牛呼吸道疾病综合征病例中牛支原体、溶血曼氏杆菌及牛病毒性腹泻病毒1型的基因组特征分析

《BMC Genomic Data》：Genomic characterization of Mycoplasma bovis, Mannheimia haemolytica, and bovine viral diarrhea virus 1 from a bovine respiratory disease complex case

　　

摘要

背景

牛呼吸道疾病是由病原体、环境因素、宿主因素以及饲养管理措施相互作用所导致的。导致牛呼吸道疾病的细菌病原体包括Mycoplasma（Mycoplasmopsis）bovis、Mannheimia haemolytica、Pasteurella multocida以及Histophilus somni。而病毒病原体则包括牛疱疹病毒1型、牛病毒性腹泻病毒（BVDV）、牛呼吸道合胞病毒、副流感3型病毒、牛冠状病毒以及D型流感病毒。

研究结果

有一例牛呼吸道疾病病例被送至加利福尼亚动物健康与食品安全实验室进行诊断分析。从该病例的肺炎肺组织样本中分离出了多种细菌和病毒病原体，其中包括M. bovis、M. haemolytica以及BVDV。这些病原体的DNA/RNA被提取出来后进行测序、分析，并与公开可用的序列数据进行了比对。M. bovis的基因组被认定为一种独特的序列类型（ST299），拥有两个新的等位基因（gltX 28和gpsA 32），其表面还含有独特的可变脂蛋白。不过，从系统发育角度来看，M. bovis的基因组也与PG45型菌株属于同一类群。M. haemolytica的基因组与其他已公开的同类基因组相似，被归为序列类型1（ST1）且血清型为1。最后，所分离出的BVDV菌株的基因组与Singer（BVDV-1a）疫苗菌株的相似度很高。

结论

由于牛呼吸道疾病较为复杂，因此研究那些在肺部同时存在多种病原体的病例具有重要的意义。本文报告了从同一个肺炎肺组织样本中分离出的三种病原体的完整基因组。值得注意的是，M. bovis的基因组属于一种独特的序列类型。未来的研究应探讨UCD-16型BVDV菌株与Singer菌株之间九个氨基酸差异对疾病发病机制的影响。