木腐线虫中钠依赖性神经递质转运蛋白家族的生物信息学分析

《BMC Genomics》：Bioinformatics analysis of the sodium-dependent neurotransmitter transporter family in Bursaphelenchus xylophilus

　　

摘要

由Bursaphelenchus xylophilus引起的松树枯萎病对全球的松林构成了严重威胁。钠依赖性神经递质转运蛋白（SNF）在将神经递质重新吸收回突触间隙中起着关键作用，从而终止神经信号传递并维持神经系统的稳态。本研究旨在全面识别B. xylophilus中的所有SNF成员，并阐明它们在线虫发育和神经系统功能中的作用。通过全基因组数据分析，我们在B. xylophilus中发现了18种SNF，并详细研究了它们的物理化学性质、保守序列特征、蛋白质结构以及不同发育阶段的基因表达情况。系统发育分析显示，这些SNF与其他线虫的SNF同源物存在进化关系，表明存在特定谱系的功能适应性差异。染色体定位结果显示，SNF基因分布在5条染色体上，编号从1到18不等。表达分析表明，Bx-snf-2、Bx-snf-6、Bx-snf-7、Bx-snf-9、Bx-snf-10在成年雄性线虫中高度表达，而Bx-snf-1和Bx-snf-4则在卵期表达量较高。此外，Bx-snf-12和Bx-snf-18在第四阶段幼虫（L4）中表现出最高的表达水平。值得注意的是，在持久期，某些Bx-snf基因的表达量上升，这表明它们可能在帮助线虫适应压力并在恶劣条件下存活方面发挥作用。这项研究首次对BxSNFs进行了系统性的分析，揭示了其独特的基因结构及特化的表达模式。这些发现为通过干扰神经递质再吸收来开发针对松树枯萎病的新型控制策略提供了潜在的分子靶点。