也门萨那市第二代和第三代头孢菌素耐药大肠杆菌临床分离株中广谱β-内酰胺酶（blaSHV、blaTEM、blaCTX-M）及AmpC β-内酰胺酶编码基因的分布情况

《BMC Microbiology》：Distribution of extended-spectrum β-lactamases (blaSHV, blaTEM, blaCTX-M) and AmpC β-lactamases -encoding genes among second- and third-generation cephalosporin-resistant Escherichia coli clinical isolates in Sana’a, Yemen

　　

摘要

背景

广谱β-内酰胺酶（ESBL）和AmpC β-内酰胺酶在大肠杆菌中的全球传播给治疗带来了挑战，导致经验性广谱抗生素治疗方案失败。在也门这样的冲突频发且资源匮乏的地区，缺乏分子监测机制使得感染控制变得困难。本研究旨在了解也门萨那市主要医疗机构中，对第二代和第三代头孢菌素（具体为头孢他啶、头孢噻肟或头孢氧辛）具有抗性的ESBL阳性、AmpC阳性以及同时产生这两种酶的大肠杆菌分离株的基因型分布情况。

方法

本研究为横断面研究，共纳入222份非重复的连续临床大肠杆菌分离株，这些分离株在常规诊断筛查中表现出对第二代和第三代头孢菌素的表型抗性或敏感性降低。这些分离株来自也门萨伊德医院、现代欧洲医院以及国家公共卫生实验室中心。通过标准生化检测和VITEK 2自动系统确认菌种。抗菌药物敏感性测试遵循CLSI标准。ESBL和AmpC的表型产生情况分别通过双盘协同试验和硼酸抑制试验进行验证。目标耐药基因（blaSHV、blaTEM、blaCTX-M、blaMOX、blaCIT、blaDHA、blaACC、blaEBC和blaFOX）则通过常规多重聚合酶链反应进行检测。统计分析采用描述性数据及皮尔逊卡方检验。

结果

在222份头孢菌素耐药分离株中，112份（50.5%）为表型ESBL产生株，90份（40.5%）为AmpC产生株，20份（9.0%）为同时产生两种酶的混合产生株。不同标本类型的感染中，ESBL产生株多见于尿路感染（58.0%，调整后残差值为+5.1），而AmpC产生株则多见于伤口感染（40.0%，调整后残差值为+5.0）。从基因型来看，ESBL产生株中blaCTX-M最为常见（112/112，95.5%），而AmpC产生株中blaEBC（50.0%）和blaFOX（37.8%）较为常见；在同时产生两种酶的分离株中，blaEBC也是最普遍的（55.0%）。共有90.5%（201/222）的分离株携带至少一种ESBL或AmpC基因。在AmpC产生株中，14.4%对亚胺培南呈现表型耐药，而在同时产生两种酶的分离株中，这一比例为20.0%。

结论

本研究分析了也门萨那市对第二代和第三代头孢菌素具有抗性的临床大肠杆菌分离株中ESBL和AmpC β-内酰胺酶的分布情况，发现blaCTX-M和blaEBC是最常见的耐药基因。高达90.5%的分离株携带至少一种β-内酰胺酶基因。ESBL与尿路感染、AmpC与伤口感染的关联特征表明，有必要针对抗生素使用策略进行有针对性的调整。此外，在AmpC产生株及同时产生两种酶的菌株中检测到碳青霉烯类抗生素耐药性，这进一步凸显了在也门临床环境中开展分子监测以追踪耐药趋势的必要性。