《Diabetologia》:Age-independent immune subtypes in type 1 diabetes exhibit distinct post-onset progression rates and immunotherapeutic responses
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目的:改进1型糖尿病(type 1 diabetes, T1D)的预防与治疗策略需深入理解其异质性。研究人员旨在利用血浆诱导转录(plasma-induced transcription)、生物信息学工具及靶向随访分析,测量新发T1D受试者中的免疫学异质性。方
目的:改进1型糖尿病(type 1 diabetes, T1D)的预防与治疗策略需深入理解其异质性。研究人员旨在利用血浆诱导转录(plasma-induced transcription)、生物信息学工具及靶向随访分析,测量新发T1D受试者中的免疫学异质性。方法:分析来自六项免疫治疗试验中560名受试者的干预前样本,采用血浆诱导转录生物测定法及标准化报告细胞群。结果:基线转录组学分析鉴定出2854个至少在五项试验中存在高变异性的转录本。无监督聚类将受试者分为两个亚组,两组平均年龄无差异,且分组在基线后纵向样本中保持稳定(p=1.4×10?14),提示分组不受短暂性复发—缓解免疫活动驱动。表型分析及独立新发T1D队列发现,亚组1富集中性或低风险HLA单倍型携带者及C肽下降速率最快的最年轻受试者(p<0.05);该亚组血浆细胞因子与趋化因子水平升高,循环CD4+CXCR3+CCR6?Th1 T细胞增多(p<0.05),且对抗CD20治疗反应更佳。亚组2富集胰岛素自身抗体阳性者、血浆miR-155-5p和miR-409-3p水平较高者(p<0.05),对CTLA4-Ig治疗反应更佳,该反应与CD4+CD45RO+CD62L+中央记忆T细胞更大幅度减少(p=8.1×10?5)及调节性T细胞(Treg)保留(p=0.02)相关。结论:上述发现支持存在免疫学上 distinct 的T1D亚组,并为未来靶向治疗干预提供了可能性。
论文解读:1型糖尿病中新发患者年龄无关免疫亚型的分型、进展差异及免疫治疗响应
《Diabetologia》发表的本研究针对1型糖尿病(type 1 diabetes, T1D)是一种由自身免疫介导的胰岛β细胞破坏所致疾病,现有免疫治疗效果短暂且个体差异大,公认其存在临床与免疫学异质性,既往提出的T1DE1/T1DE2内型(endotype)与发病年龄密切相关,但缺乏不依赖年龄、基于功能性免疫状态的亚型划分框架。研究人员假设新发T1D患者血浆诱导外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMC)的转录特征可反映潜在免疫异质性,并与β细胞功能衰退及免疫治疗响应相关联,因此利用多中心临床试验样本开展无监督分型验证。
主要关键技术方法
研究使用两大样本队列:发现队列为Type 1 Diabetes TrialNet六项为新发T1D设计的免疫治疗试验(抗CD20/利妥昔单抗NCT00279305、CTLA4-Ig/阿巴西普NCT00505375、MMF-DZB NCT00100178、GAD疫苗NCT00529399、抗IL-1β/卡那奴单抗NCT00947427、ATG-GCSF NCT02215200)中共560例诊断100天内、≥1种胰岛自身抗体阳性、刺激C肽≥0.2 nmol/l的受试者基线(及部分3–6月)血浆;验证队列为威斯康星儿童医院61例新发T1D局部队列。核心技术含:血浆与冻存标准PBMC共培养后全基因组 microarray 检测血浆诱导转录本,加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)筛选高变异转录本并做无监督层次聚类(hierarchical clustering, HCL)与PCA/tSNE分型;独立队列用K Top Scoring Pairs(KTSP)分类器验证;Luminex 71-plex检测血浆细胞因子/趋化因子;RT-qPCR检测血浆microRNA(miRNA);谱流式细胞术(spectral flow cytometry)分析T细胞亚群(Th1/Th2/Th17/Tfh/Treg、中央记忆T细胞);混合效应模型(linear mixed-effect model, LMM)与ANCOVA评估C肽下降速率(rate of decline, ROD)及免疫治疗分组交互效应。
研究结果
Association of variation in plasma-induced transcription with beta cell function
研究人员对406名<18岁受试者WGCNA构建8个转录模块,模块与β细胞表型(2 h C肽曲线下面积AUC、C肽ROD等)相关性在有效治疗组(抗CD20、CTLA4-Ig、TG-GCSF)安慰剂臂多于治疗臂,提示免疫干预减弱了疾病相关活动;无效治疗试验也存在此趋势。证实筛选出的2854个高变异探针集可反映T1D疾病相关免疫活动。
Unsupervised clustering reveals age-independent subgroups
对全队列(儿童n=406,成人n=154)2854探针集做HCL与PCA均将受试者稳定分为亚组1(Subgroup 1, SG1, n=291)与亚组2(SG2, n=269),两组成年与儿童平均无差异;纵向3–6月安慰剂样本再分类准确率73.6%(AUC=0.82, p=1.4×10?14),证明分型非短暂免疫波动所致。按<7岁、7–13岁、>13–18岁、≥18岁分层仍各自分出两亚组,表明分型跨年龄存在;SG1中<7岁个体基线C肽AUC最低、C肽ROD最快。
Canonical pathway and upstream regulator analysis reveals proinflammatory and immunoregulatory divergence across subgroups
IPA(Ingenuity Pathway Analysis)通路富集显示SG1上调TNF、IFN-γ、LPS预测上游调控子及Th1相关转录本(CCR1、CCR5、HAVCR2、T-bet/TBX21依赖),SG2上调Th17相关转录本(IL21R、IL23A、BATF、RORc/STAT3依赖)及miR-155-5p宿主基因MIR155HG。取年龄无关的差异表达探针(1082个)做上游调控分析,预测SG1先天免疫受体活化、SG2部分miRNA抑制模式,证实两亚组具不同免疫偏移方向。
Phenotypic characteristics of subgroups 1 and 2
全队列两亚组性别、BMI、青春期分期、平均年龄无差异;SG2胰岛素自身抗体(IAA)阳性比例偏高(p_adj=0.08),SG1中性/低风险HLA单倍型比例偏高(p_adj=0.09);安慰剂组中SG1更快C肽ROD(≤?0.15/月)者占比更高(p_adj=0.09)。儿童亚组中SG1 <14岁者及快速C肽衰退者富集更显著(p_adj=0.05–0.06)。
Validation of plasma-induced transcriptional signatures in a local cohort
局部队列n=61经同样2854探针集HCL再分为两亚组,KTSP模型分类准确率83.1%(AUC=0.96, p=3.02×10?9),验证分型可重复;但因样本量小未重现HLA/自身抗体表型差异。
Subgroup 1 exhibits elevated plasma cytokine/chemokine profiles
局部队列71-plex蛋白检测显示SG1多种炎症与调节性介质(IFN-γ、TNF-α、IL-6、IL-10、CCL7等)均值高于SG2,方向与转录预测一致,但单个因子未通过多重较正,提示需组合判别。
Subgroup 2 exhibits elevated plasma miRNA profiles
RT-qPCR显示SG2血浆miR-155-5p(4.13倍, p_adj=0.028)与miR-409-3p(2.11倍, p_adj=0.053)显著高于SG1;其已知靶基因在SG2血浆诱导转录中低表达,符合miRNA介导mRNA降解机制。
Plasma SCFA profiles
短链脂肪酸(short-chain fatty acid, SCFA)中仅乙酸酯在SG1轻度升高(p_adj=0.098),其余(丙酸、丁酸等)无组间差异。
Subgroup 1 exhibits increased Th1 CD4+T cell abundance
流式显示SG1循环CD4+CXCR3+CCR6?Th1细胞占CD4+T细胞比例高于SG2(3.82% vs 2.33%, p=0.046),Th1/Treg比值更高(p=0.018);B细胞、单核、CD8+、Th2、Th17、Tfh、Treg频率无组间差异。
Subgroups 1 and 2 differentially respond to immunotherapy
抗CD20(利妥昔单抗)治疗臂中SG1 C肽AUC高于同组安慰剂(meta p=0.002),延迟达C肽等效降幅时间为11.2月(SG2仅5.41月且无治疗vs安慰剂差异),提示SG1对B细胞清除疗法响应更好。CTLA4-Ig(阿巴西普)治疗臂中SG2 C肽AUC高于同组安慰剂(meta p=3.0×10?4),延迟降幅时间8.70月(SG1为5.76月且无治疗vs安慰剂差异);流式显示SG2经CTLA4-Ig后CD4+CD45RO+CD62L+中央记忆T细胞缩减更显著(24.3%, p=8.1×10?5vs SG1中11.9%),Treg丢失较少(33.6% vs SG1中40.8%),且中央记忆T细胞变化与SG2中C肽保存相关(p=0.0057)。TG-GCSF两亚组均显示治疗臂C肽ROD低于安慰剂但无组间C肽AUC差异。无效试验(MMF-DZB、GAD Vx、抗IL-1β)未见亚组特异响应。
讨论与结论翻译
本研究提出一种不依赖于发病年龄的T1D免疫亚型划分框架,经多中心大样本验证且纵向稳定。SG1偏向Th1/先天炎症、富集低危HLA及快速β细胞衰退年轻患者,对B细胞靶向抗CD20响应较好;SG2偏向Th17/miRNA调控、富集胰岛素自身抗体及miR-155-5p/miR-409-3p升高,对共刺激阻断CTLA4-Ig响应较好且伴随中央记忆T细胞更明显缩减与Treg较好保留。两亚型在未成年与成年患者中均可辨识,部分转录具年龄依赖性但与分型正交。研究局限含横断面设计限制因果推断、单项试验内亚组样本量限制统计效能,需前瞻验证。结论:这些发现支持新发T1D存在免疫学上不同的亚型(immune subtypes),并为未来个体化(precision medicine)免疫治疗干预提供了依据。