《NMR in Biomedicine》:Automated Surface-Based Segmentation of Deep Gray Matter Regions Based on Diffusion Tensor Images Reveals Unique Age Trajectories Over the Healthy Lifespan
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许多研究已证明深部灰质(GM)体积在发育和衰老过程中存在独特轨迹,提示但未测量微结构改变。仅少数研究在深部GM中测量了扩散张量成像(DTI)参数,或在大队列的宽年龄范围内报告了这些数值。由于许多临床方案不采集T1加权图像,且T1加权与扩散图像之间的配准容易出错
许多研究已证明深部灰质(GM)体积在发育和衰老过程中存在独特轨迹,提示但未测量微结构改变。仅少数研究在深部GM中测量了扩散张量成像(DTI)参数,或在大队列的宽年龄范围内报告了这些数值。由于许多临床方案不采集T1加权图像,且T1加权与扩散图像之间的配准容易出错,本研究提出一种完全基于DTI计算的参数图(parametric maps)的自动分割技术,从而无需额外结构成像即可高效进行大队列深部GM的DTI研究。该算法通过将三维(3D)模型变形至扩散加权图像(DWI)和DTI图上可见的边界,分割五个皮层下GM结构。这种仅基于DTI的方法与标准T1加权分割进行了比较,使用了1.5 mm各向同性测试-重测扩散数据(n=24)。方法间Dice系数在10个结构中的5个较高(>0.7),但在左/右苍白球、左/右杏仁核和右海马较低。所提出的仅DTI分割在定性上更准确,且对全部10个结构产生更小的体积。随后,将该分割方法应用于“寿命”队列(n=357,5–90岁,203名女性),以评估体积、各向异性分数(FA)和平均扩散率(MD)的年龄变化。对于全部五个结构,MD轨迹呈二次函数,先下降约在30–35岁后上升。对于苍白球和海马,FA轨迹在5至约25岁保持平坦,随后在5–90岁范围内开始下降;杏仁核FA线性下降,纹状体FA线性上升,丘脑FA保持恒定。值得注意的是,DTI的轨迹与深部GM体积的轨迹不同。所提出的仅DTI自动深部GM分割方法将促进深部GM的DTI分析(这在大多数研究中通常未测量),并将有益于那些没有T1加权扫描的研究,例如许多临床人群。
**研究背景与问题**
深部灰质(deep gray matter, GM)结构(如苍白球、纹状体、丘脑、海马、杏仁核)的体积在健康寿命中呈现非线性轨迹:儿童期至青春期增长,约15–25岁达峰,此后随衰老下降。然而,这些体积变化仅反映了宏观结构改变,微观结构(microstructural)变化的研究相对匮乏。扩散张量成像(diffusion tensor imaging, DTI)可提供各向异性分数(fractional anisotropy, FA)和平均扩散率(mean diffusivity, MD)等互补参数,但现有DTI研究多局限于手动勾画感兴趣区(ROI),耗时且难以覆盖全结构。常用自动分割方法需依赖额外采集的T1加权图像(T1w),但配准易受空间扭曲和分辨率差异影响,且T1w图像在苍白球、丘脑等边界处灰白质对比度不足,导致分割误差。因此,开发一种仅基于DTI图像的自动分割方法,可避免配准问题,并适用于未采集T1w的临床方案。
**研究内容与结论**
研究人员提出了一种基于表面的自动分割算法,利用DTI参数图(FA+MD复合图和平均b1000 DWI)的边界对比度,通过3D网格变形分割五个深部GM结构(苍白球、纹状体、丘脑、海马、杏仁核)。方法在1.5 mm各向同性测试-重测数据(n=24)中验证,与FreeSurfer T1w分割相比,Dice系数在丘脑和纹状体较高(>0.70),而在苍白球和杏仁核较低(<0.70)。可重复性良好(重测Dice系数0.79–0.94)。随后应用于寿命队列(n=357,5–90岁),发现:MD轨迹呈U形(约30–35岁最低),FA轨迹因结构而异(苍白球和海马呈倒U形,杏仁核线性下降,纹状体线性上升,丘脑稳定)。这些DTI轨迹与体积轨迹不同,表明DTI提供了深部GM微结构成熟与衰老的独特信息。论文发表在《NMR in Biomedicine》。
**主要关键技术方法**
研究人员首先对扩散数据进行预处理(包括非中心卡方分布校正、去噪、吉布斯伪影校正、运动和涡流畸变矫正),并拟合张量模型生成FA和MD图。提出FA+MD(1000×)复合图,将FA和MD相加以同时增强灰质-白质和灰质-脑脊液边界。分割算法基于3D网格变形:初始网格由非线性配准获得的概率图谱生成,随后通过外部图像力(驱动网格向平均b1000 DWI或FA+MD复合图的最大强度梯度移动)和外部图谱力(基于概率图谱调节边界约束)使网格贴合目标结构边界。内部力维持表面光滑。对于海马和杏仁核,先联合分割再采用期望最大化(EM)算法(ANTs Atropos)分离。所有数据来自阿尔伯塔大学规范脑成像数据库(University of Alberta Normative Brain Imaging Database),包括测试-重测队列(n=24)和寿命队列(n=357,5–90岁,203名女性)。
**研究结果**
**3.1 深部GM在原生DTI上的分割评估**:定性评估显示,对苍白球、纹状体、丘脑的分割在所有24名受试者中准确,但海马和杏仁核偶有错误(如海马侧向扩展到皮质,杏仁核前边界包含皮质)。
**3.2 与标准T1加权分割方法的比较**:相比FreeSurfer T1w分割,所提方法对所有10个结构生成更小体积(差异范围-9%至-38%,p<0.001)。方法间Dice系数:左/右丘脑最高(0.80/0.84),左/右苍白球(0.64/0.69)和右海马(0.69)较低,左/右杏仁核最低(0.50/0.59)。定性分析显示FreeSurfer常将内囊白质体素纳入苍白球和丘脑分割,而DTI方法因FA图对比度优势可排除这些体素。
**3.3 可重复性分析**:测试-重测Dice系数0.79(左杏仁核)至0.94(左/右丘脑)。组内相关系数(ICC)对较大结构(纹状体0.92–0.97,丘脑0.96–0.98)较高,对小结构(苍白球0.80–0.83,杏仁核0.67–0.75)较低,但扫描间体积无显著差异(p>0.05)。重测数据中相同的分割错误可重复出现。
**3.4 深部GM DTI指标及体积与年龄的关系**:寿命队列中,FA值从高到低依次为丘脑(0.25)、苍白球(0.23)、杏仁核(0.18)、纹状体(0.16)、海马(0.14);MD值从低到高为苍白球(0.78×10
-3 mm
2/s)、纹状体(0.81)、杏仁核(0.86)、丘脑(0.87)、海马(0.93)。年龄轨迹:所有五个结构MD呈二次或三次U形拟合(最低点约30–40岁);FA轨迹——苍白球和海马呈二次拟合(5–60岁平坦后下降),杏仁核线性下降,纹状体线性上升,丘脑呈稳定三次轨迹。体积轨迹:DTI分割与FreeSurfer T1w分割的轨迹在纹状体、丘脑、海马、杏仁核大致相似,但苍白球在儿童期至青春期出现矛盾趋势(DTI显示增长,T1w显示下降),可能因T1w对比度随髓鞘化而变化。
**3.5 深部GM DTI指标的性别差异**:男性所有五个结构体积均大于女性(p<0.001)。MD在男性中较高(除杏仁核外四个结构,p<0.001),而FA无显著性别差异。发育和衰老轨迹在两性间相似,但体积轨迹存在定性差异(如男性苍白球、丘脑、杏仁核在30–50岁体积增长更多)。
**讨论与结论**
研究人员提出一种仅基于DTI的自动深部GM分割方法,利用FA+MD复合图和平均b1000 DWI的对比度进行3D网格变形,避免了T1w图像的需求和配准误差。与FreeSurfer T1w分割相比,该方法在边界清晰区域(如丘脑)一致性高,而在对比度不足区域(如苍白球、杏仁核)差异较大,但DTI方法在内部囊边界处具有对比度优势。寿命队列中,深部GM的MD和FA轨迹呈现区域特异性,且与体积轨迹不同,表明DTI能捕捉到体积测量无法反映的微结构变化。研究结论部分翻译如下:
**结论**:本文提出一种完全自动化的分割方法,直接利用扩散图像测量五个深部GM结构(苍白球、纹状体、丘脑、海马、杏仁核)的DTI参数。该分割利用平均b1000 DWI和FA+MD复合图的对比度,将3D网格变形至各目标结构边界。与标准T1w FreeSurfer分割相比,该方法对五个深部GM结构生成相似的分割,且由于FA+MD复合图在内外囊区域具有优越的灰白质对比度,可能优于T1w分割方法。在包含357名参与者(5–90岁)的典型发育和衰老队列中,每个深部GM结构的FA和MD均观察到独特的发育和衰老轨迹,且与其体积轨迹不同,提示DTI可提供深部GM脑成熟的额外信息。该自动仅DTI分割无需T1w成像,具有明显优势,将有益于未来在发育、衰老或临床人群中对深部GM扩散特性开展研究,尤其是当T1w图像增加总采集时间或并非常规采集时。