分析卵巢癌患者阴道微生物群的组成与多样性

《Communications Medicine》：Characterizing the composition and diversity of the vaginal microbiome in ovarian cancer

　　

摘要

背景

阴道菌群失调表现为乳酸杆菌数量减少而厌氧菌增多，可能与卵巢癌的预后相关，但目前针对卵巢癌患者的全面菌群分析仍十分有限。本研究旨在探讨美国不同种族卵巢癌患者中阴道菌群失调的患病率及其影响因素。

方法

我们对作为基于人群的ORCHiD研究的一部分而招募的132名卵巢癌患者的阴道样本进行了16S rRNA基因测序。同时运用潜在狄利克雷分配这一计算主题建模方法，识别出代表不同细菌群落的特征模式。

结果

研究发现，仅有47.7%的患者体内存在乳酸杆菌。通过主题建模，我们识别出了七种不同的菌群特征，这些特征分别对应以乳酸杆菌为主的菌群类型和厌氧菌占比较高的菌群类型。随着年龄增长，厌氧菌的数量显著增加（每增加10岁，其比例上升约35%，FDR q值=0.019）。不同种族之间存在差异：非西班牙裔黑人患者中属于放线菌科的扩增子序列变异体ASV54的检出率是非西班牙裔白人患者的5倍（分别为40.9%和8.2%，FDR q值=0.005）；而在该研究群体中，只有非西班牙裔白人患者体内存在干酪乳杆菌（检出率为6.4%，而非西班牙裔黑人患者为0%）。

结论

这些研究结果表明，卵巢癌患者中阴道菌群失调的发病率较高，同时发现了与年龄和种族相关的菌群特征，这些特征有助于解释卵巢癌预后存在的差异。