TFAP2A诱导的长链非编码RNA NUTM2A-AS1上调通过miR-409-5p/SLC35F2调控轴促进LUAD进展

《Journal of Cellular and Molecular Medicine》:TFAP2A-Induced Upregulation of LncRNA NUTM2A-AS1 Promotes LUAD Progression Through a miR-409-5p/SLC35F2 Regulatory Axis

【字体: 时间:2026年07月12日 来源:Journal of Cellular and Molecular Medicine 4.7

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  长链非编码RNA(LncRNA)在肺腺癌(LUAD)进展中发挥关键作用。然而,LncRNA NUTM2A-AS1在LUAD中的上游转录调控和下游机制仍 largely unexplored。研究人员使用公共数据库和qRT-PCR分析LUAD组织和细胞系中NUT

  
长链非编码RNA(LncRNA)在肺腺癌(LUAD)进展中发挥关键作用。然而,LncRNA NUTM2A-AS1在LUAD中的上游转录调控和下游机制仍 largely unexplored。研究人员使用公共数据库和qRT-PCR分析LUAD组织和细胞系中NUTM2A-AS1、TFAP2A、miR-409-5p和SLC35F2的表达水平。通过CCK-8、Transwell和凋亡实验评估该轴在LUAD细胞中的生物学功能。通过染色质免疫沉淀(ChIP)、双荧光素酶报告基因和RNA免疫沉淀(RIP)实验验证TFAP2A、NUTM2A-AS1、miR-409-5p和SLC35F2之间的分子相互作用。NUTM2A-AS1和TFAP2A在LUAD中均显著上调,并与不良预后相关。机制上,转录因子TFAP2A直接结合NUTM2A-AS1启动子以激活其转录。功能上,NUTM2A-AS1促进LUAD细胞增殖、迁移、侵袭和上皮间充质转化(EMT),同时抑制凋亡。此外,NUTM2A-AS1可能通过与miR-409-5p相互作用作为竞争性内源RNA样调节因子,从而上调溶质载体家族成员SLC35F2的表达。拯救实验表明,SLC35F2敲低减弱了TFAP2A或NUTM2A-AS1诱导的致癌表型,而miR-409-5p恢复抑制了SLC35F2表达和细胞周期进程。研究人员的研究支持一个促成LUAD进展的TFAP2A/NUTM2A-AS1/miR-409-5p/SLC35F2调控模型。这些发现表明TFAP2A/NUTM2A-AS1/miR-409-5p/SLC35F2轴有助于LUAD进展,并可能提供潜在的生物标志物和治疗靶点。
肺腺癌(LUAD)是肺癌最常见的亚型,约占所有肺癌病例的40%,常于晚期确诊,5年总生存率低于20%。尽管手术、化疗和免疫治疗取得进展,但LUAD发病率和死亡率仍居高不下,其分子发病机制尚不完全清楚,尤其缺乏特异性生物标志物和治疗靶点。长链非编码RNA(LncRNA)作为表观遗传调控因子在肿瘤发生中发挥重要作用,但LncRNA NUTM2A-AS1在LUAD中的转录调控和下游机制尚未明确。溶质载体家族成员SLC35F2在多种恶性肿瘤中具有促癌作用,但其在LUAD中的功能和调控机制仍不清楚。研究人员基于前期对非小细胞肺癌(NSCLC)的研究,聚焦LUAD,旨在阐明NUTM2A-AS1的调控网络及其生物学功能。研究人员证实,转录因子TFAP2A直接结合NUTM2A-AS1启动子并上调其表达,NUTM2A-AS1作为竞争性内源RNA(ceRNA)海绵吸附miR-409-5p,进而解除对SLC35F2的抑制,最终驱动LUAD恶性进展。该研究揭示了TFAP2A/NUTM2A-AS1/miR-409-5p/SLC35F2调控轴在LUAD进展中的关键作用,为LUAD提供了新的潜在生物标志物和治疗靶点。论文发表在《Journal of Cellular and Molecular Medicine》。

研究人员主要采用以下关键方法:利用公共数据库(TCGA、GEPIA、ENCORI/starBase)进行生物信息学分析;在体外细胞系(正常支气管上皮细胞BEAS-2B及LUAD细胞系A549、H358、HCC827)和体内异种移植瘤模型(BALB/c裸鼠)中验证功能;通过qRT-PCR、Western blot检测基因和蛋白表达;采用CCK-8、EdU、集落形成实验评估增殖;Transwell实验评估迁移和侵袭;流式细胞术检测细胞周期和凋亡;染色质免疫沉淀(ChIP)验证转录因子结合;双荧光素酶报告基因和RNA免疫沉淀(RIP)验证RNA相互作用;生物素标记miRNA pull-down验证直接结合。样本队列来源:34对LUAD组织和配对癌旁组织来自上海交通大学医学院附属同仁医院。

**3.1 LncRNA NUTM2A-AS1 Is Upregulated in LUAD Tissues**
通过TCGA数据库(UALCAN)分析发现,LncRNA NUTM2A-AS1在LUAD组织(n=533)中表达显著高于正常对照(n=59),且高表达与不良预后显著相关。独立队列(34对组织和5对微阵列)验证了这一上调。亚细胞分离显示该LncRNA主要定位于细胞质,符合ceRNA机制。

**3.2 TFAP2A Is Highly Expressed in LUAD and Correlates With NUTM2A-AS1**
GEPIA数据分析显示TFAP2A在LUAD中显著上调,高表达与较差总生存期和晚期临床分期相关。qRT-PCR在34对样本中证实TFAP2A上调。体外敲低或过表达TFAP2A后,NUTM2A-AS1水平相应降低或升高,且两者在临床样本中呈正相关。

**3.3 TFAP2A Transcriptionally Activates LncRNA NUTM2A-AS1**
双荧光素酶报告实验在A549细胞中鉴定出NUTM2A-AS1启动子关键区域(?729至?717 bp)。JASPAR数据库预测TFAP2A结合位点位于此区域。ChIP-qPCR证实TFAP2A直接结合该启动子区域,TFAP2A敲低后该区域荧光素酶活性显著降低。

**3.4 TFAP2A Promotes LUAD Progression In Vitro and In Vivo**
EdU、CCK-8和集落形成实验表明,TFAP2A过表达增强LUAD细胞增殖和克隆形成,敲低则抑制。体内异种移植瘤模型显示,TFAP2A过表达增加肿瘤体积和重量,敲低则相反。

**3.5 LncRNA NUTM2A-AS1 Promotes LUAD Progression In Vitro and In Vivo**
EdU、CCK-8和集落形成实验显示NUTM2A-AS1过表达促进LUAD细胞增殖和克隆形成,敲低抑制。体内实验证实NUTM2A-AS1过表达促进肿瘤生长,沉默则抑制。

**3.6 LncRNA NUTM2A-AS1 Regulates SLC35F2 Expression to Drive LUAD**
GEPIA和qRT-PCR显示SLC35F2在LUAD中高表达且与NUTM2A-AS1正相关。NUTM2A-AS1敲低降低SLC35F2表达,过表达增加。拯救实验表明SLC35F2过表达恢复NUTM2A-AS1敲低导致的增殖抑制,而SLC35F2敲低逆转NUTM2A-AS1过表达的促增殖效应。

**3.7 NUTM2A-AS1 Interacts With miR-409-5p and Regulates SLC35F2 Expression**
ENCORI预测7个miRNA同时结合NUTM2A-AS1和SLC35F2。微阵列和RIP实验鉴定miR-409-5p为潜在靶标,AGO2-RIP证实两者共沉淀。双荧光素酶报告和生物素pull-down验证miR-409-5p直接结合NUTM2A-AS1和SLC35F2 3'UTR。Western blot显示miR-409-5p抑制SLC35F2蛋白水平,NUTM2A-AS1过表达可逆转此抑制。临床样本中miR-409-5p下调并与SLC35F2负相关。

**3.8 The NUTM2A-AS1/miR-409-5p/SLC35F2 Axis Regulates Cell Proliferation**
流式细胞术和Western blot显示miR-409-5p mimics诱导G0/G1期阻滞,NUTM2A-AS1过表达或SLC35F2过表达可挽救此阻滞。拯救实验表明SLC35F2敲低减弱TFAP2A过表达诱导的细胞活力和集落形成。

**3.9 The TFAP2A/NUTM2A-AS1/SLC35F2 Axis Regulates Migration, Invasion, EMT-Associated Changes and Apoptosis in LUAD Cells**
在HCC827细胞中,TFAP2A过表达减少凋亡,SLC35F2敲低恢复凋亡。Transwell实验显示TFAP2A过表达促进迁移和侵袭,SLC35F2敲低消除此效应。Western blot显示TFAP2A过表达诱导EMT标志物变化(E-cadherin下调,N-cadherin和Vimentin上调),SLC35F2敲低逆转。NUTM2A-AS1敲低促进凋亡(Bax和cleaved Caspase-3上调,Bcl-2下调),SLC35F2过表达反转此变化。

讨论部分总结:研究人员构建了“转录因子/ceRNA/溶质载体”级联模型,首次在LUAD中整合TFAP2A/NUTM2A-AS1/miR-409-5p/SLC35F2轴。TFAP2A作为转录因子直接激活NUTM2A-AS1,后者海绵吸附miR-409-5p以解除对SLC35F2的抑制,从而驱动增殖、转移和EMT。SLC35F2作为溶质载体家族成员,其促癌作用可能通过代谢重编程和蛋白糖基化实现。研究局限性包括:缺乏体内肺转移模型;ceRNA机制的生理相关性依赖于RNA化学计量,外源过表达可能夸大内源效应;SLC35F2在LUAD中转运的具体代谢物未明确;临床相关性主要依赖TCGA数据库,需多中心前瞻性队列验证。尽管存在局限,该轴仍为LUAD提供了新的生物标志物和治疗靶点。

研究结论:总之,本研究强调了LncRNA NUTM2A-AS1在LUAD中的致癌作用。研究人员证明,TFAP2A诱导的NUTM2A-AS1上调通过作为miR-409-5p的ceRNA样调节因子并随后上调SLC35F2,在体外和体内促进LUAD进展。这些发现为LUAD的分子发病机制提供了新见解,并提示TFAP2A/NUTM2A-AS1/SLC35F2轴是一个有前景的治疗靶点。
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