东方泰勒虫的地理分布与基因型多样性，重点研究印度分离株

《Scientific Reports》：Geographical distribution and genotypic diversity of Theileria orientalis with emphasis on Indian isolates

　　

摘要

在全球范围内，Theileria orientalis会给牛群带来巨大的经济损失。本研究对T. orientalis的MPSP序列进行了深入分析，以探究其系统发育、遗传多样性及种群结构。我们在2023年至2025年间对印度北部的800份血液样本进行了显微镜检测。结果显示，牛群中Theileria的感染率为29.25%，而水牛的感染率为2.75%。针对18S rRNA基因的PCR扩增检测显示，39.5%的牛和6.0%的水牛体内存在该病原体。此外，针对T. orientalis的特异性PCR检测则显示，牛群中的感染率为4.5%，水牛为3.0%。系统发育分析涵盖了来自不同地理区域的981个MPSP序列，其中包括来自印度的15个新分离株。分析结果共发现了12种基因型，被分为1–5型、7型、8型以及N1–N5型。本研究还支持了这些基因型分类的最新观点，即6型与Theileria sinensis高度相似，而9型似乎属于4型谱系。此外，我们发现GenBank中的分类存在错误，例如8型分离株被错误地归类为4型，反之亦然。在印度，我们共识别出8种基因型，其中2型、N1型和N5型是首次被报道。地理分析表明，1型和3型具有全球性分布特征。该寄生虫种群的遗传多样性很高，共有552种单倍型，核苷酸多样性（π）为0.14，单倍型多样性（Hd）为0.988。所有12种基因型的单倍型多样性均保持较高水平，同时Tajima’s D和Fu’s Fs统计值也呈现显著负值，这些都表明该寄生虫种群正在不断扩大。不同的T. orientalis基因型之间的Fst值较高，Nm值较低，这反映出它们之间存在显著的遗传差异，且基因流较为有限。