摘要
属于黄病毒科的Orthopestivirus属包含多种重要病原体，如经典猪瘟病毒（CSFV）、牛病毒性腹泻病毒1型和2型（BVDV-1和BVDV-2）以及边界病病毒（BDV）。尽管哥斯达黎加存在BVDV的地方性流行，但该国仍未出现CSFV和BDV的病例，这凸显出在猪群中开展病原体监测和鉴别诊断时需要可靠的分子检测方法。本研究验证了一种针对病原体5′非翻译区（5′UTR）的传统广谱RT-PCR检测方法，该基因区域在Orthopestivirus属的各类成员中具有高度保守性。目前已有许多基于PCR的病原体检测方法被开发出来，但其中很多是专门用于检测牛源病原体，如牛病毒性腹泻病毒1型（BVDV-1）、BVDV-2以及类似HoBi的病原体（HoBiPeV）。而本研究中的检测方法经过标准化和验证，能够检测多种病原体，因此可作为一种有用的工具，用于不同宿主物种的监测和诊断工作。为评估该方法的诊断灵敏度和特异性，共分析了66份参考样本，同时还检测了其分析灵敏度、重复性、再现性及选择性。此外，从2014年到2025年还进行了病原体监测。该方法的检测下限分别为CSFV为1.2拷贝/μL，BVDV为11.7拷贝/μL，诊断灵敏度和特异性分别达到98%和100%。总共检测了1072份监测样本，其中包括11份牛源样本和1061份猪源样本。2015年采集的2份猪源样本检测出病原体，且属于BVDV-2a组，这是哥斯达黎加首次通过分子检测发现猪源BVDV-2a。同时也确认了牛源中存在BVDV-1b。该方法作为广谱病原体监测工具表现良好，若能与序列分析相结合以确定病原体种类，还可为无CSFV国家的鉴别诊断提供帮助。
