一项学术分子检测项目中对同源重组缺陷生物标志物的全面临床癌症分析

《npj Precision Oncology》：Comprehensive clinical cancer analysis of homologous recombination deficiency biomarkers in an academic molecular profiling program

　　

摘要

PARP抑制剂对存在同源重组修复缺陷（HRD）的肿瘤具有治疗效果，这类缺陷通常可通过种系或肿瘤突变来识别。然而，基因检测可能无法准确判断肿瘤对PARP抑制剂的敏感性及耐药性。我们在500多个肿瘤样本以及20多组液体活检样本中，结合基因、基因组及功能检测方法，评估了提高HRD检测精度及长期监测效果的策略。在高级别卵巢癌中，HRD的发生率为52%，而转移性乳腺癌为12%，前列腺癌为20%。不同检测方法的结果一致性较低至中等，这体现了各种检测方法的互补性。通过RAD51检测和基因组不稳定性评分，即便在缺乏致病性HRR突变的肿瘤中，也能检测出HRD，其在转移性乳腺癌中的检出率为6%和30%，在高级别卵巢癌中分别为38%和46%，在前列腺癌中为14%和27%。长期进行ctDNA测序发现，在接受PARPi治疗后的转移性乳腺癌样本中，有超过30%存在BRCA1/BRCA2基因的逆转突变，这类突变与后续铂类药物治疗效果不佳相关。这些研究结果支持在组织活检和液体活检中运用多种互补的HRD生物标志物，以指导PARPi的使用并监测治疗效果。