利用长读长测序的maker介导优化技术结合MLPA验证，对遗传性听力障碍中的STRC变异进行综合分析

《Molecular Medicine》：Integrated analysis of STRC variants in hereditary hearing impairment using maker-mediated refinement of long-read sequencing with MLPA validation

　　

摘要

背景

感音神经性听力损失是一种具有显著遗传因素的常见疾病。由于STRC基因的基因组结构十分复杂，存在大型重排以及高度同源的假基因，传统的下一代测序技术往往无法准确识别该基因中的致病变异。长读长测序技术则能更好地解析这些复杂的基因区域。

方法

我们开发了一套完整的工作流程，将基于PacBio的长读长测序技术与标记辅助的精细化分析以及MLPA验证相结合，以此有效应对假基因带来的干扰。在通过对100名遗传病因不明的台湾感音神经性听力损失患者进行初步的下一代测序筛查后，我们应用了这一方法来分析他们的STRC基因。

结果

我们在11名无关患者中发现了双等位基因的STRC变异（诊断率为11%），包括纯合缺失、复合杂合缺失与转换，以及复合杂合单核苷酸变异和拷贝数变异。所有通过双等位基因STRC变异得以确诊的无关病例均患有轻度或中度感音神经性听力损失，占本研究中所统计的73名轻度至中度该疾病患者的15.1%。

结论

我们的研究结果表明，将长读长测序技术与经MLPA检测验证的标记辅助精细化分析相结合的策略，在检测复杂的STRC变异方面具有重要的诊断价值，有助于进一步阐明那些传统下一代测序技术无法解决的感音神经性听力损失的遗传病因。

图形摘要