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综述:多祖先多基因预测的证据标准
《Genome Biology》:Evidence standards for multi-ancestry polygenic prediction
【字体: 大 中 小 】 时间:2026年07月14日 来源:Genome Biology 9.2
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摘要多基因评分(PGS)是用于健康筛查、预防和试验的前瞻性工具,但大多数是基于欧洲的全基因组关联研究构建的,在非欧洲人群以及具有混合祖先背景的人群中,其准确性和校准性会下降。多祖先方法日益增多,但相应的基准标准却落后。本综述重点探讨跨人群预测的基准设计。我们展示了祖先归属、连锁不
多基因评分(PGS)是用于健康筛查、预防和试验的前瞻性工具,但大多数是基于欧洲的全基因组关联研究构建的,在非欧洲人群以及具有混合祖先背景的人群中,其准确性和校准性会下降。多祖先方法日益增多,但相应的基准标准却落后。本综述重点探讨跨人群预测的基准设计。我们展示了祖先归属、连锁不平衡参考、变异集合、参数调整以及特征结构如何影响其表现。我们提出了一种评估体系,涵盖区分度、校准性、公平性差距以及计算成本,并通过不同人群的测试和现实模拟进行验证。最后,我们阐述了可实时审计的基准框架的未来愿景。
多基因评分(PGS)是用于健康筛查、预防和试验的前瞻性工具,但大多数是基于欧洲的全基因组关联研究构建的,在非欧洲人群以及具有混合祖先背景的人群中,其准确性和校准性会下降。多祖先方法日益增多,但相应的基准标准却落后。本综述重点探讨跨人群预测的基准设计。我们展示了祖先归属、连锁不平衡参考、变异集合、参数调整以及特征结构如何影响其表现。我们提出了一种评估体系,涵盖区分度、校准性、公平性差距以及计算成本,并通过不同人群的测试和现实模拟进行验证。最后,我们阐述了可实时审计的基准框架的未来愿景。
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