摘要
Rho GTP酶激活蛋白（RhoGAPs）具有保守的RhoGAP结构域，作为Rho GTP酶的负调控因子，在植物生长、发育以及对环境刺激的反应中起着重要作用。在本研究中，从大豆基因组中鉴定出了19个GmRhoGAP基因，这些基因分布在11条染色体上且分布不均。研究人员进行了多项分析，包括基因结构、保守序列 motif、蛋白质结构域、基因重复现象、基因连锁关系、顺式作用元件、组织特异性表达情况，以及在根瘤菌感染条件下的定量实时PCR分析。结构分析显示，这些基因的内含子-外显子组织存在较大差异，但序列 motif的组成却高度保守，所有基因都含有保守的RhoGAP结构域。研究还发现了20对部分重复的基因对，这表明大豆中的GmRhoGAP基因家族正在不断扩展。跨物种的基因连锁关系分析显示，这类基因与拟南芥的进化关系更为密切，而Ka/Ks分析则表明在进化过程中存在强烈的自然选择作用。启动子分析表明，这些基因可能参与植物的发育、植物激素信号传导、应激反应以及光响应过程。表达谱分析显示，这些基因在不同组织中的表达模式存在差异。qRT-PCR分析进一步表明，GmRhoGAP基因在根瘤菌感染时的表达情况各不相同，其中10个基因的表达水平上升，4个基因的表达水平下降。这些分析为了解这一基因家族提供了依据，也为未来研究筛选候选基因奠定了基础。
