多族群医疗系统生物库中神经发育障碍拷贝数变异的基因型分类回顾

《npj Genomic Medicine》：Recall-by-genotype of neurodevelopmental disorder copy number variants in a multi-ancestry, healthcare-system biobank

　　

摘要

将电子健康记录与基因型数据相连接的临床生物样本库，有助于在真实人群中研究基因组风险因素。然而，在不同医疗系统的生物样本库中，基于基因型召回精神疾病风险变异的研究仍然十分少见。我们利用西奈山医疗系统内的多族群生物样本库BioMe，找到了那些携带会增加神经发育障碍风险的罕见拷贝数变异的个体，以此为基于基因型的召回方法建立实证参考标准。我们重新联系了892名参与者：335名携带NDD相关CNV的个体，217名患有精神分裂症但无此类CNV的个体，以及340名无NDD相关CNV的正常对照组。这些参与者完成了临床和认知评估。总体而言，有18%的被重新联系的参与者回应了招募邀请，其中8%完成了整个研究：30名携带NDD相关CNV的个体，20名精神分裂症患者，以及23名正常对照组。参与者的平均年龄为48.8岁，66%为女性，自我报告的祖先背景中，37%为非洲裔，34%为西班牙裔，26%为欧洲裔。70%的携带NDD相关CNV的个体至少有一种神经精神或发育障碍，其中40%患有情绪或焦虑障碍。在那些与认知功能受损相关的基因位点上，22名携带此类CNV的个体的测试表现低于正常对照组，尤其是在数字广度逆向测试（β?=?–1.76，FDR?=?0.04）和数字广度序列测试（β?=??2.01，FDR?=?0.04）中。此外，携带NDD相关CNV的个体在语言学习测试中的表现也优于精神分裂症组（β?=?4.5，FDR?=?0.05）。通过这种方式召回包括精神疾病患者在内的各类个体，能够发现电子健康记录中未记录的表型特征，从而为在不同医疗系统中实施基于基因型的召回方法以及发展精准精神病学提供重要的实证参考。