海胆Glyptocidaris crenularis的染色体级基因组组装

《Scientific Data》：Chromosome-level genome assembly of the sea urchin Glyptocidaris crenularis

　　

摘要

海胆Glyptocidaris crenularis是Glyptocidaris属（Phymosomatidae科）中唯一的物种，分布于中国黄海北部以及日本海的部分地区。作为一种重要的可食用海胆，由于其营养价值和经济价值，它受到了大量研究关注。在本研究中，通过使用Illumina短读长序列、Pacbio长读长序列以及Hi-C测序技术，构建了G. crenularis的基因组。该基因组包含22条染色体，这与Strongylocentrotidae科的海胆（如Strongylocentrotus intermedius、Hemicentrotus pulcherrimus和Mesocentrotus franciscanus）以及Echinometridae科的海胆Anthocidaris crassispina所具有的21条染色体不同。该基因组的序列长度为772.09 Mb，Scaffold N50长度为33.67 Mb。共注释出18965个基因，其中94.72%的基因已确定功能。这一基因组为研究G. crenularis的重要经济性状及其进化规律提供了宝贵的基因组资源。