非结核分枝杆菌的临床特征及纳米孔靶向测序在诊断中的应用：一项回顾性队列研究

《Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials》：Clinical features of nontuberculous mycobacteria and diagnosis with nanopore targeted sequencing: a retrospective cohort study

　　

摘要

背景

肺部非结核分枝杆菌病的诊断仍然具有挑战性，不仅因为其临床表现常与结核病相似，还因其症状如慢性咳嗽、咳痰、疲劳和体重下降等与其他常见呼吸系统疾病，包括慢性阻塞性肺疾病、反复肺部感染和慢性支气管炎，极为相似。这类症状的重叠常常导致诊断延迟或错误，而确诊所需的培养过程耗时较长，进一步阻碍了及时诊断。在肺部非结核分枝杆菌病发病率上升的背景下，纳米孔靶向测序技术作为一种快速且全面的病原体检测方法，展现出巨大潜力。本研究旨在评估该技术的临床应用价值，重点考察其诊断性能、识别病原体种类以及发现多重微生物感染的能力。

方法

在这项回顾性研究中，我们分析了2023年至2025年间在南京第二医院接受的350名疑似肺部非结核分枝杆菌感染患者的病例。我们研究了这些患者的临床特征、病原体情况以及是否存在多重感染。研究中对支气管肺泡灌洗液、痰液和组织样本进行了纳米孔靶向测序分析，并将这一方法的诊断效果与传统的抗酸杆菌涂片、分枝杆菌种类鉴定以及常规培养等方法进行了比较。

结果

在350名患者中，有293人被确诊为肺部非结核分枝杆菌病。与非结核分枝杆菌病组（n=57）相比，该组的年龄显著更大（中位数年龄分别为61.0岁和43.5岁）。非结核分枝杆菌病患者存在明显的细胞免疫功能异常，表现为CD3?、CD4? T细胞水平以及CD4?/CD8?比例较低，且疾病病程比对照组更长。两组患者的BMI没有显著差异。最常见的临床症状是咳痰，影像学检查主要显示斑片状肺实质病变和结节影。诊断性能评估结果显示，纳米孔靶向测序的灵敏度最高（95.9%），AUC值也最高（0.892），不过其特异性（82.5%）略低于分枝杆菌培养法（84.2%）。而分枝杆菌培养法虽然特异性很高，但灵敏度却很低（50.5%）。维恩图分析表明，纳米孔靶向测序检测出的阳性病例数量最多，这体现了它作为全面诊断工具的优势。此外，对多重感染的分析显示，非结核分枝杆菌病患者中有多达56.0%存在多重微生物感染，其中结核分枝杆菌和人类疱疹病毒是最常见的共病原体，其他常见共感染菌还包括曲霉菌、念珠菌和铜绿假单胞菌。还有复杂的多种微生物混合感染情况，这反映出肺部非结核分枝杆菌病中的微生物环境十分复杂，也凸显出需要采用更为全面的诊断策略。

结论

纳米孔靶向测序是一种快速且灵敏度极高的检测工具，能够同时实现病原体种类鉴定和多重感染分析，有望提升肺部非结核分枝杆菌病的诊断水平。不过，要充分发挥其作用，需将其与临床信息、影像学检查结果及免疫学数据相结合，以便准确区分真正感染与定植情况，从而为有效治疗提供依据。