尼日利亚东南部部分野生大型真菌的分子鉴定

《BMC Genomic Data》：Molecular identification of some wild macrofungi from Southeastern Nigeria

　　

摘要

蘑菇的利用程度极低，而且驯化尝试也未能取得显著成果，因为非洲及世界大部分地区所食用的蘑菇中，仍有超过95%是从野外采集的。然而，由于形态学鉴定错误，野生蘑菇的实用价值与商业化进程受到了阻碍。包括内部转录间隔区（ITS）在内的分子标记在蘑菇多样性研究中被证明十分有效。本研究旨在调查尼日利亚东南部本土野生蘑菇的多样性。研究团队在该地区的5个州通过随机抽样方法收集了50份野生蘑菇样本。使用Zymo Research Quick-DNA植物/种子微量提取试剂盒进行DNA提取，再通过PCR扩增ITS区域，随后运用Sanger测序技术进行测序。最后在Genbank数据库中通过BLASTn搜索来确定这些蘑菇的物种身份。虽然DNA条带质量参差不齐，但基因组DNA仍成功被提取并扩增。50份样本中有41份被成功测序并鉴定出物种。这些蘑菇物种被归为11个科，其中多孔菌科（13种）、伞菌科（9种）、牛肝菌科（7种）和层孔菌科（4种）的数量最多。Trametes属有7种，Lentinus属有6种，数量居前，其次是Neonothopanus属（5种）和Ganoderma属（4种）。条形码标记（ITS区域）在识别尼日利亚东南部的野生蘑菇方面效果显著。