Craticula vanensis sp. nov.，一种具有复杂线粒体基因组的新型硅藻，栖息于中欧和安纳托利亚的碱性湖泊中

《Scientific Reports》：Craticula vanensis sp. nov., a new species of diatom with a complex mitogenome, inhabiting soda lakes in central Europe and Anatolia

　　

摘要

本文正式描述了来自世界最大的碱湖——凡湖的一种新的硅藻物种Craticula vanensis sp. nov.。这是81年来的研究间隔后在该湖发现的第五种新物种。通过基于短读长的基因组分析方法，研究人员获得了完整的核rRNA基因群以及完整的质体基因组，这些数据随后被用于多种单基因或多基因系统发育分析，结果出人意料地表明C. vanensis与Dorofeyukea属的物种有亲缘关系。而线粒体基因组的复杂结构则只能通过长读长测序才能解析。该基因组的特征包括较大的长度（116,698 bp）、cox1基因中存在多个内含子、采用不同的遗传密码系统，其中UGA密码子被重新指定为精氨酸，此外还存在六份rRNA基因拷贝以及九份截短的序列拷贝。对已发表的宏条形码数据集的分析表明，C. vanensis也存在于中欧的一个碱湖（匈牙利的Kakasszéki湖）中，这一发现后来通过显微镜观察得到了证实，说明该物种的分布范围可能更广。