U1 snRNP蛋白U1C以及U1 snRNA的Helix H结构对于小分子剪接调节功能至关重要

《Nature Communications》：The U1 snRNP protein U1C and Helix H of U1 snRNA are critical for small molecule splicing modulator function

　　

摘要

里斯迪普兰和布拉纳普兰属于两类小分子剪接调节剂，能够促进U1 snRNP识别那些含GA/GU序列的弱非典型5’剪接位点。我们发现，在体外实验中，布拉纳普兰能够增强重组U1 snRNP对这类5’剪接位点的识别能力，且这一效应依赖于U1C的ZnF结构域以及U1 snRNA的Helix H结构域，而与U1A或U1-70K无关。此外，我们还发现布拉纳普兰通过加强U1 snRNP与5’剪接位点之间的相互作用以及U1 snRNP与U1C之间的相互作用，从而提升对弱5’剪接位点的识别能力。在细胞中，减少U1C的表达会降低或完全消除这些化合物所诱导的大多数盒式外显子的包含现象。有趣的是，有一部分盒式外显子只有在U1C被敲低后才会对这类化合物产生反应，这表明U1C能够以依赖具体环境的方式稳定5’剪接位点与U1 snRNA之间的特定构象，进而影响化合物的结合。令人意外的是，里斯迪普兰在体外实验中对弱5’剪接位点的识别并无影响，这说明其发挥作用还需要其他细胞因子参与。