重组与多样化选择推动了tet(X)阳性大肠杆菌的适应性进化

《European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases》：Recombination and diversifying selection drive the adaptive evolution of tet(X)-Positive Escherichia coli

　　

摘要

研究目的

本研究旨在分析全球携带tet(X)基因的Escherichia coli的群体结构、重组特征以及多样化模式。

研究方法

我们对1721份全球范围内携带tet(X)基因的E. coli基因组进行了系统发育分析、重组分析以及多样化选择分析。

研究结果

这些菌株主要分布在中国（72.7%），且大多数携带tet(X4)变异体（97.5%），其中A类系统群（61.4%）和B1类系统群（26.8%）最为常见。研究发现tet(X4)与IncHI1A/IncHI1B质粒及IS存在显著正相关关系，blaCTX?M?65与IncI存在显著正相关关系，而blaOXA?181则与IncX3存在显著正相关关系。系统发育分析显示，17号系统群（30.6%）和7号系统群（17.7%）是最为常见的菌系，其中一些同时携带tet(X)基因以及blaCTX?M、blaNDM和blaOXA基因的菌株在不同国家之间具有较高的遗传相似性（

结论

携带tet(X)基因的E. coli的适应性进化是由水平基因转移、克隆扩增以及多样化选择共同推动的，这凸显了开展全球基因组监测的紧迫性。