2011–2024年阿拉斯加西南部高致病性禽流感病毒引入后的禽流感病毒生态变化

《npj Viruses》：Ecological shifts in avian influenza viruses following HPAIV introductions in southwestern Alaska, 2011–2024

　　

摘要

阿拉斯加西南部的湿地是那些在北美西部和东亚繁殖的候鸟的重要中途停留地。自2011年起，人们每年在阿拉斯加的伊曾贝克国家野生动物保护区及其周边地区，收集来自被猎杀的候鸟以及环境中的粪便样本，以监测禽流感病毒（AIVs）的出现、演变和传播情况。在该地区生活的野生鸟类体内始终能检测到病毒，而且还观察到了频繁的跨大陆病毒传播现象。2014年和2022年，在北美的太平洋迁徙路线上检测到了H5亚型的高致病性禽流感病毒（HPAIVs），这可能受到了当时在候鸟群体中传播的低致病性禽流感病毒（LPAIVs）的基因和抗原多样性的影响。相反，HPAIVs的出现也可能改变了在野生水鸟宿主体内共存的LPAIVs的生态状况。为了解析这些生态相互作用，我们研究了LPAIV和HPAIV出现频率及多样性方面的长期变化趋势，重点关注与HPAI引入事件相关的变化。在14年的禽流感病毒监测期间，病毒流行率在HPAIV引入时期达到峰值。HPAIVs与LPAIVs之间的重组产生了新的HPAIV基因型，以及一种融合了HPAIV基因片段的LPAIV。2022年HPAIVs引入后，欧亚谱系的基因片段比例有所上升。这一长期数据集展现了在北美一个持续进行禽流感病毒主动监测的地点，野生鸟类体内的LPAIVs和HPAIVs的生态状况所发生的变迁。