叶蜂Nematus trochanteratus的染色体级基因组测序与组装

《Scientific Data》：Chromosome-level genome assembly of the sawfly Nematus trochanteratus

　　

摘要

Nematus trochanteratus（Malaise，1931年）（膜翅目：叶蜂科）是一种专性植食性害虫，仅以柳树（Salix属）为食，对森林和园林生态系统造成严重的生态与经济危害。目前尚未有该物种的高质量参考基因组序列公布，这限制了对其遗传演化及基因功能的研究。在本研究中，我们通过整合PacBio HiFi长读长测序、Illumina短读长测序以及Hi-C染色质构象捕获数据，构建了N. trochanteratus的高质量染色体级基因组组装序列。最终得到的基因组大小为188.07兆碱基对，骨架序列的N50值为23.87兆碱基对，同时成功构建了9条伪染色体。利用昆虫通用单拷贝同源基因数据库（BUSCO）评估后，该基因组的完整性约为97.2%。通过系统注释，共鉴定出11,540个蛋白质编码基因，重复序列占基因组的21.74%，此外还有多种非编码RNA基因。这一基因组为膜翅目叶蜂的系统发育及功能基因组研究提供了宝贵的资源。