铜死亡相关的AL139023.1/miR-139-5p/ELOVL5 ceRNA轴调控食管鳞状细胞癌的增殖、迁移和细胞周期

《Cancer Management and Research》:The Cuproptosis-Associated AL139023.1/miR-139-5p/ELOVL5 ceRNA Axis Regulates Proliferation, Migration, and Cell Cycle in Esophageal Squamous Cell Carcinoma

【字体: 时间:2026年07月19日 来源:Cancer Management and Research 2.6

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  目的:研究铜死亡(cuproptosis)相关的竞争性内源RNA(ceRNA)网络在食管鳞状细胞癌(ESCC)中的调控机制,并阐明AL139023.1/miR-139-5p/ELOVL5轴在ESCC进展中的作用。患者与方法:研究人员使用ESCC实验室模型,在抑

  
目的:研究铜死亡(cuproptosis)相关的竞争性内源RNA(ceRNA)网络在食管鳞状细胞癌(ESCC)中的调控机制,并阐明AL139023.1/miR-139-5p/ELOVL5轴在ESCC进展中的作用。患者与方法:研究人员使用ESCC实验室模型,在抑制ELOVL5后定量铜离子和活性氧(ROS)。功能实验评估细胞增殖、细胞周期进程和迁移。报告基因实验评估AL139023.1与miR-139-5p之间的ceRNA相互作用,拯救实验验证AL139023.1-ELOVL5调控依赖性。结果:抑制ELOVL5触发了ESCC细胞的铜死亡。AL139023.1/miR-139-5p/ELOVL5轴调控ESCC细胞增殖、细胞周期进程和迁移。AL139023.1作为竞争性内源RNA海绵吸附miR-139-5p以上调ELOVL5表达。AL139023.1对ESCC恶性进展的促肿瘤作用部分依赖于ELOVL5。结论:这些发现揭示了ESCC中由AL139023.1/miR-139-5p/ELOVL5轴介导的一个新的铜死亡相关ceRNA调控网络,该轴有望作为ESCC的诊断生物标志物、预后指标和治疗靶点,突出了其临床相关性。
**论文解读:铜死亡相关AL139023.1/miR-139-5p/ELOVL5 ceRNA轴在食管鳞状细胞癌中的调控机制**

**研究背景、问题与意义**

食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)是一种高度侵袭性的恶性肿瘤,具有快速进展、早期转移和预后极差的特点。尽管在外科手术、化疗、放疗及免疫治疗方面取得了一定进展,但ESCC患者的五年生存率仍不理想。现有治疗手段存在诸多局限:手术仅适用于早期患者,放化疗常导致严重毒性和治疗抵抗,免疫检查点抑制剂仅对部分患者有效。因此,迫切需要探索新的分子通路和潜在治疗靶点,以改善ESCC的治疗效果。

非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA),特别是微小RNA(microRNA, miRNA)和长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA),在癌症基因表达调控中发挥重要作用。miRNA通常通过结合互补mRNA抑制靶基因表达,而lncRNA可作为竞争性内源RNA(competing endogenous RNA, ceRNA)调节miRNA活性。越来越多的证据表明,失调的ncRNA网络参与ESCC的进展,包括增殖、转移和治疗抵抗。其中,miR-139-5p已被报道在多种癌症(包括ESCC)中充当肿瘤抑制因子,抑制迁移、侵袭和血管生成,但其上游调控机制尚不完全清楚。此外,lncRNA AL139023.1在ESCC中的作用尚未阐明,其可能参与的ceRNA调控网络有待进一步研究。

调节性细胞死亡(regulated cell death, RCD)对维持细胞稳态至关重要,并在癌症发展和治疗反应中发挥关键作用。近年来,一种新型铜依赖性RCD形式——铜死亡(cuproptosis)被鉴定。该过程由细胞内铜积累触发,导致脂酰化线粒体蛋白聚集、铁硫簇蛋白不稳定,进而引发蛋白毒性应激。新兴证据表明,铜死亡与肿瘤代谢和线粒体功能密切相关,可能成为癌症的潜在治疗脆弱点。尽管关于ESCC中铜死亡的研究仍有限,但初步发现表明铜死亡相关基因的失调可能影响肿瘤进展和代谢重编程,凸显了进一步研究的必要性。

ELOVL5属于极长链脂肪酸延伸酶(ELOVL)家族,通过催化多不饱和脂肪酸的延伸在脂质代谢中发挥关键作用。ELOVL5的异常调控已在多种癌症中被报道,脂质组成的变化影响膜动力学、信号通路和细胞能量稳态。ELOVL5是细胞脂肪酸生物合成和代谢重编程的重要调节因子。由于脂质代谢与线粒体功能和氧化呼吸链紧密相关,ELOVL5的失调可能间接影响细胞氧化还原平衡和代谢脆弱性。然而,ELOVL5与铜死亡之间的关系尚未被报道。这一知识空白凸显了探究ELOVL5介导的脂质代谢过程是否与铜诱导的细胞死亡通路在ESCC中交叉的必要性。

针对上述问题,研究人员开展了本研究,旨在揭示铜死亡相关的ceRNA调控轴(AL139023.1/miR-139-5p/ELOVL5)在ESCC中的作用,并评估其作为诊断标志物、预后指标和治疗靶点的潜力。该研究填补了ESCC研究领域的一个重要空白,为理解铜死亡与ncRNA调控的交叉提供了新视角,论文发表在《Cancer Management and Research》。

**主要关键技术方法**

研究人员使用了来自癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库的198例食管癌患者数据(包括13对肿瘤和癌旁组织)进行差异表达和生存分析。通过共识聚类(consensus clustering)将患者分为铜死亡相关亚群。利用TargetScan、miRanda和miRTarBase预测ceRNA相互作用,构建ceRNA网络。体外实验使用ESCC细胞系KYSE-150和TE-1(购自中国科学院上海细胞库),通过CCK-8实验、细胞迁移实验(Boyden chambers)、细胞周期分析(流式细胞术)、RT-qPCR、Western blot、荧光素酶报告基因实验、Seahorse细胞外流量分析(OCR)等技术评估功能。体内实验采用裸鼠皮下移植瘤模型,通过瘤内注射ASO敲低AL139023.1。

**研究结果**

**1. 筛选与ESCC恶性进展相关的lncRNA、microRNA和mRNA**:通过13对ESCC肿瘤与癌旁组织的差异表达分析,鉴定出1010个上调mRNA、913个下调mRNA、426个上调lncRNA、326个下调lncRNA、64个上调miRNA和9个下调miRNA。单变量Cox分析筛选出与生存相关的基因,其中AL139023.1高表达与不良预后显著相关(p=0.043),ROC曲线显示其AUC值较高(AUC=0.57)。

**2. 铜死亡相关基因的共识聚类分析**:基于13个铜死亡相关基因的表达谱,将198例ESCC患者分为两个亚群(k=2),Kaplan-Meier分析显示Cluster 1预后显著优于Cluster 2(p=0.043)。差异表达基因富集于细胞周期相关通路。

**3. 筛选调控ESCC恶性进展的铜死亡相关ceRNA网络**:整合差异表达数据,构建包含29个lncRNA、2个miRNA和7个mRNA的ceRNA网络,共107个相互作用连接。通过高表达丰度和生存分析,确定AL139023.1为关键lncRNA,miR-139-5p为关键miRNA,从而锁定AL139023.1/miR-139-5p/ELOVL5轴。

**4. ELOVL5是ceRNA轴AL139023.1/miR-139-5p调控的关键mRNA**:通过ASO敲低AL139023.1后,RT-qPCR检测显示ELOVL5表达显著下调,而其他潜在靶mRNA(DCBLD2、GPR37、TBX1)无显著变化。使用铜死亡诱导剂elesclomol处理,发现ELOVL5敲低后铜离子浓度、脂酰化DLAT和DLST蛋白表达显著升高,且铜死亡抑制剂TTM可逆转这些效应。OCR检测显示ELOVL5敲低增强elesclomol诱导的线粒体呼吸。因此,ELOVL5敲低增加了ESCC细胞对铜死亡诱导剂的敏感性。

**5. AL139023.1、miR-139-5p和ELOVL5调控ESCC的增殖、迁移和细胞周期**:GSEA分析显示,这三个基因调控的差异表达基因主要富集于细胞周期、细胞增殖和细胞迁移通路。功能实验证实,抑制AL139023.1或ELOVL5,或过表达miR-139-5p,均抑制ESCC细胞增殖和迁移,并诱导细胞周期阻滞。

**6. AL139023.1和miR-139-5p调控ESCC中的ELOVL5**:敲低AL139023.1后,ELOVL5表达下调而miR-139-5p上调。过表达miR-139-5p(mimic)导致AL139023.1和ELOVL5表达下调,抑制miR-139-5p(inhibitor)则上调两者表达。这符合ceRNA调控特征。

**7. AL139023.1作为miR-139-5p的ceRNA调控ELOVL5,进而影响ESCC增殖**:Pearson相关性分析显示AL139023.1与miR-139-5p高度负相关(r=-0.7423,p<0.0001)。双荧光素酶报告基因实验证实AL139023.1可直接结合miR-139-5p。在ELOVL5敲低背景下,敲低AL139023.1不再抑制细胞增殖;过表达ELOVL5可部分逆转AL139023.1敲低引起的增殖抑制。体内实验进一步证实,在ELOVL5过表达组中,敲低AL139023.1无法抑制肿瘤生长或减轻肿瘤重量,而在对照组中则显著抑制。

**总结讨论与结论**

本研究揭示了一个此前未被认知的ESCC调控轴:AL139023.1作为miR-139-5p的ceRNA,调控铜死亡相关基因ELOVL5。研究人员证明抑制ELOVL5增强了细胞内铜积累和ROS生成,从而促进铜死亡。功能与富集分析表明,AL139023.1/miR-139-5p/ELOVL5通路协调ESCC细胞增殖、细胞周期进程和迁移等关键恶性表型。通过报告基因实验的机制验证进一步确认了AL139023.1与miR-139-5p之间的ceRNA相互作用调控ELOVL5表达。这些发现展示了ESCC中一个铜死亡相关的ceRNA调控网络,拓宽了当前对代谢脆弱性如何整合到ncRNA介导的基因调控中的理解。研究结论:AL139023.1/miR-139-5p/ELOVL5铜死亡相关ceRNA轴有望作为ESCC的诊断生物标志物、预后指标和治疗靶点,突出了其临床相关性。未来需要临床队列研究验证该ceRNA轴的转化价值,探索靶向该通路的新治疗策略。
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