《Journal of Agricultural and Food Chemistry》:Perspectives of Bacterial PAPS-Independent Aryl Sulfotransferases for Practical In Vitro Sulfation
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PAPS非依赖性细菌芳基磺基转移酶(ASTs)不像哺乳动物磺基转移酶那样需要昂贵且不稳定的辅因子PAPS。相反,研究人员使用简单的芳香硫酰供体。最初在肠道细菌中发现,ASTs表现出显著的底物多样性,催化酚类、醇类、胺类、糖类和多酚类(包括黄酮类和黄酮木脂素类)
PAPS非依赖性细菌芳基磺基转移酶(ASTs)不像哺乳动物磺基转移酶那样需要昂贵且不稳定的辅因子PAPS。相反,研究人员使用简单的芳香硫酰供体。最初在肠道细菌中发现,ASTs表现出显著的底物多样性,催化酚类、醇类、胺类、糖类和多酚类(包括黄酮类和黄酮木脂素类)的硫酸化。其中,来自Desulfitobacterium hafniense的AST(DhAST)因其稳定性和广泛的底物范围而特别引人注目。结构和机制研究表明,ASTs遵循一种乒乓双-双机制(ping-pong bibi mechanism),并涉及瞬时酶硫酸化。最近从不同细菌物种中鉴定出的新ASTs以及重组表达方面的进展,拓宽了这些酶在体外选择性、可规模化合成硫酸化代谢物方面的潜力。扩大现有的AST文库加深了对细菌硫酸化途径的理解,并支持其在生物催化、代谢物合成以及硫酸化生物分析标准品生产中的应用。
微生物PAPS非依赖性ASTs:第一个假定的PAPS非依赖性芳基磺基转移酶(AST)在米曲霉(Aspergillus oryzae)粗提物中被发现,其通过形成酶-硫酸盐中间体,遵循乒乓反应机制,且不能利用PAPS作为硫酰供体。首个报道的细菌AST来自人类肠道微生物群中的Eubacterium A-44,表现出严格的磺基转移酶活性,且其活性可通过添加供体底物如对硝基苯基硫酸盐(pNPS)来促进。随后,许多研究中的ASTs来自哺乳动物肠道微生物群,如Haemophilus K-12、Klebsiella K-36等,其中Klebsiella K-36的astA基因首次在大肠杆菌中异源表达,成为首个重组AST。其他重组ASTs还来自Enterobacter amnigenus AR-37、Citrobacter freundii等,这些ASTs均含有两个连续开放阅读框astA和dsbA,后者编码硫醇-二硫键氧化还原酶(DsbA),引导AST进入周质。来自尿路致病性大肠杆菌CFT073的EcAST,其结构中含有一个关键的二硫键,且需要DsbL/DsbI系统才能高效产生功能性AST。来自Desulfitobacterium hafniense的DhAST是研究最深入的细菌AST之一,它能硫酸化小芳香醇、脂肪醇、糖类、类固醇和多酚类物质,且因高稳定性可在粗细胞裂解液中直接使用。基于序列同源性分析,研究人员鉴定并表达了多个新候选AST,如来自Desulfosporosinus sp. HMP52的DsAST、Desulfofalx alkaliphila的DalAST等。此外,生物信息学分析在人类肠道微生物Sutterella属中发现了潜在AST,并在Bacteroides vulgatus中鉴定出新型AST(BvAST),其具有广泛的底物特异性。
结构与功能:哺乳动物磺基转移酶(SULTs)遵循顺序双-双机制,需要辅因子PAPS参与。而细菌ASTs遵循乒乓双-双催化机制,通过形成酶-供体中间复合物进行反应。早期研究利用标记的硫酰供体(35S)-对硝基苯基硫酸盐分离出中间体,并鉴定出硫酸化氨基酸为酪氨酸。随后,对Enterobacter amnigenus AST的定点诱变表明,第123位酪氨酸是关键活性位点氨基酸。目前,EcAST是唯一具有解析晶体结构的AST,其晶体结构(PDB: 3ELQ)显示为同源二聚体,每个单体包含N端7链β-三明治结构域和C端6叶β-螺旋桨结构域。进一步分析表明,EcAST通过乒乓机制催化硫酰基转移,涉及His436的瞬时硫酸化,这是一种此前未知的蛋白质共价修饰。而以前研究提出的酪氨酸残基(如Tyr96)在EcAST中远离活性位点,不参与催化。活性位点由碱性氨基酸His252、His356、Asn358、Arg374和Thr501组成,它们可能协调硫酰基团并解释催化所需的碱性pH。对多种AST的序列比对揭示了两个不同簇:簇I主要来自变形菌门,簇II来自厚壁菌门。DhAST和EcAST分别属于不同簇。催化组氨酸残基(EcAST的His436)及其相邻残基在所有已知AST中高度保守,而之前提出的Tyr96仅在簇I中保守(除BvAST外)。
AST的底物:ASTs对硫酰供体和受体均具有特异性。最常用的供体是对硝基苯基硫酸盐(pNPS)和4-甲基伞形酮硫酸盐(MUS),后者荧光检测灵敏度更高,前者更常用于常规活性测定和制备性硫酸化。其他供体包括对硝基儿茶酚硫酸盐、对乙酰基苯基硫酸盐、吲哚酚硫酸盐、苯基硫酸盐、α-或β-萘基硫酸盐等。新型供体N-羟基琥珀酰亚胺硫酸盐和N-邻苯二甲酰亚胺硫酸盐也被提出,但前者对产物分布影响有限,后者未检测到活性。近期研究还测试了生物相关硫酸化化合物如对乙酰氨基酚硫酸盐、多巴胺硫酸盐等作为供体。尽管多种供体被测试,pNPS因其易得、显色、可检测且不易被重硫酸化,仍是首选。所有报道的ASTs均不能利用PAPS作为供体,但来自Haliangium ochraceum的HocST显示出独特的PAPS依赖性芳基磺基转移酶活性,并可能具有类似AST的活性。
硫酰受体方面,早期研究集中于小酚类化合物如苯酚、儿茶酚、酪胺、对羟基苯甲酸酯类及含酪氨酸肽段。DhAST的突破性进展在于能硫酸化脂肪醇如丁醇、2-苯乙醇、甘油等,以及类固醇如雌酮和雌二醇,制备反应中17β-雌二醇-3-O-硫酸盐产率达80%。对糖类底物的硫酸化,通过将糖基连接芳香基团(如苯酚或pNP)可提高转化率,但直接硫酸化糖类效率较低。通过定向进化获得的DhAST突变体ASTB-V1(Val579Asp)对葡萄糖的活性提高了5.4倍。此外,来自Hungatella effluvii的HefAST对N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)的活性比DhAST高约6倍,是合成硫酸化糖和寡糖的有前景工具。多酚类受体是另一重要类别,如来自水飞蓟的黄酮木脂素(水飞蓟宾、异水飞蓟宾等),DhAST可实现高效区域选择性硫酸化,产物光学纯度好。相比之下,哺乳动物AstIV只能硫酸化水飞蓟宾B,且产率低。在黄酮类化合物中,优先硫酸化位点为C-3′和C-4′羟基,随后是C-7,可形成二硫酸酯。间苯三酚等多数酚酸因羧基降低反应pH而难以硫酸化,但对香豆酸因共轭双键而可作为合适受体。胺类化合物如苯胺和环己胺也可被某些ASTs硫酸化,表明ASTs能硫酸化氨基。一些底物如白杨素因缺乏B环羟基而硫酸化效率低,但新型ASTs如DalAST和CfAST可提高其转化率至9%。总体而言,ASTs的受体范围已大幅扩展,未来研究可关注更大更复杂的受体如抗生素及糖胺聚糖(GAGs)等。解析关键AST(如DhAST和DalAST)的晶体结构将为理性酶工程和底物改造铺平道路。