Crateva unilocularis（十字花科）的完整细胞器基因组

《BMC Genomic Data》：The complete organelle genomes of Crateva unilocularis (Capparaceae)

　　

摘要

研究目的

Crateva unilocularis是葫芦科中一种广泛食用的木本蔬菜。本研究旨在利用PacBio HiFi长读长测序技术，构建并全面解析该物种的首个完整线粒体基因组，明确其结构组成与基因分布。同时，我们还报道了该物种的完整叶绿体基因组。这些细胞器基因组资源为后续研究Crateva unilocularis及其近缘种的系统发育、基因组结构及适应性进化提供了基础。

数据描述

Crateva unilocularis的叶绿体基因组长度为156,525 bp，包含78个独特的蛋白质编码基因、28个转运RNA以及4个核糖体RNA。此外，基因组组装图显示存在三个环状线粒体分子，总长度为566,203 bp，而跨越连接处的HiFi测序读段则验证了这些分子的组装结构。经过注释后，共识别出59个基因，其中包括37个蛋白质编码基因、19个转运RNA和3个核糖体RNA。这些已组装并完成注释的细胞器基因组，可作为Capparaceae科中Crateva unilocularis的关键参考序列，有助于未来的比较基因组学及功能基因组学分析。