《Research and Practice in Thrombosis and Haemostasis》:Proteomics-Based Clustering for Higher Risk of Venous Thromboembolism in Patients with Nephrotic Syndrome
编辑推荐:
摘要引言肾病综合征患者发生静脉血栓栓塞症的风险较高且存在差异性。高凝状态被认为是重要因素,但其背后的分子机制尚未明确。本研究旨在识别出VTE风险较高的肾病综合征患者,并通过蛋白质组学分析探究相关关键通路和分子。方法对49名肾病综合征患者的血清蛋白质组数据进行了分析,采用了无监督共
摘要
引言
肾病综合征患者发生静脉血栓栓塞症的风险较高且存在差异性。高凝状态被认为是重要因素,但其背后的分子机制尚未明确。本研究旨在识别出VTE风险较高的肾病综合征患者,并通过蛋白质组学分析探究相关关键通路和分子。
方法
对49名肾病综合征患者的血清蛋白质组数据进行了分析,采用了无监督共识聚类分析(筛选前1,000种变异蛋白,K值设为2)以及基因集变异分析。通过分析找出差异表达蛋白,进而构建蛋白质-蛋白质相互作用网络以确定核心蛋白。比较了不同聚类组中核心蛋白的水平,并分析了它们与肾功能临床生物标志物之间的关联。研究以2年内VTE的累积发病率为主要终点,还通过轨迹分析研究了各聚类组肾功能的变化趋势。
结果
无监督聚类将样本分为两组。与第1组相比,第2组患者基线时及2年内的VTE发病率均更高(基线VTE发病率为43%对比11%,P值为0.13;2年累积VTE发病率为58%对比22%,P值为0.074),且该组在细胞外基质组织构建及细胞间相互作用通路上的活性更为活跃。差异表达蛋白分析显示第2组有145种蛋白表达上调,蛋白质-蛋白质相互作用网络分析则确定了9种潜在的核心蛋白(CTNNB1、VCAN、POSTN、SDC1、MMP2、SERPINC1、APOA1、PCSK9、LIPC),这些蛋白在第2组中的表达水平均显著升高,其中MMP2和POSTN与肾小管损伤的标志物存在关联。
结论
血清蛋白质组学分析帮助识别出了一部分VTE风险较高的肾病综合征患者。在肾病综合征患者中,细胞外基质及内皮糖萼的损伤可能在VTE的发生发展中起重要作用。
Xin Liu|Jing Ma|Yanshuang Lyu|Xiaomeng Zhang|Wanlu Song|Peiran Yang|Zhenguo Zhai|Guohui Fan|Dingyi Wang
中国北京医院肾脏科,国家老年医学中心;中国医学科学院老年医学研究所暨北京协和医学院