《Veterinary Research Communications》：Diversity of Candida spp. isolated from microbiota and infectious processes in wild mammals: a systematic review
念珠菌属（Candida）的酵母菌在临床实践中具有显著相关性，特别是在重症监护室（intensive care units, ICUs）中，因其对免疫受损（immunocompromised）患者的影响而被归类为高风险病原体（high-risk pathogens）。尽管如此，与其他感染性病原体相比，真菌常常被忽视，其在生态学中的作用，特别是与野生动物（wildlife）相关的部分，仍未得到充分探索。历史上，野生动物一直被河岸和农村社区用作生存资源，尽管近年来此类消费已受到日益严格的监管。野生动物、家养物种和人类之间的相互作用促进了微生物在不同生态位之间的交换，从而增加了病原微生物传播的风险，并强调了“One Health”概念（One Health concept）的原则。因此，本研究文献综述整合了关于从野生哺乳动物（wild mammals）的共生部位和感染过程中分离念珠菌属（Candida spp.）的研究。共分析了34项研究，涵盖21种念珠菌属（Candida）物种，涉及74种哺乳动物。虽然念珠菌属（Candida spp.）存在于绝大多数健康个体中，但它们在自由放养动物中的存在可能作为这些栖息地生态变化和人为影响的指标。此外，在特定情况下，这些共生菌可能引起感染，特别是在免疫脆弱的情况下。这些数据强调了进一步研究野生动物在传播这些酵母菌中作为热点或哨兵角色的必要性，有助于监测和管理新兴疾病，以及野生种群的健康与保护。
**引言**
近几十年来，人与动物之间的关系因城市扩张、环境破坏、野生动物贸易和畜牧业集约化等因素而日益密切。这些互动导致未知或监测不足的感染性病原体成为重大公共卫生威胁，例如近期COVID-19大流行，该疾病最初在野生动物中发现，随后传播至人类群体。这一事件强调了在“One Health”（One Health）框架内进行综合监测和预防策略的重要性，认识到人类、动物和环境健康之间的相互关联性。
动物驯化过程促进了不同物种间微生物遗传信息的交换。具体而言，非常规宠物（如鸟类和爬行动物）的日益流行，以及将野生动物用于丛林肉消费和衍生产品制造，进一步加剧了这种近距离接触。这种通常不受监管或非法的接触使人类暴露于动物间传播的病原体，这些病原体有时会找到有利条件跨越物种屏障。
狩猎、外来动物贩卖和野生动物肉商业化在世界各地（包括巴西）是常见做法，促进了新兴传染病的出现。此外，自然栖息地的持续破坏（由森林砍伐、采矿和农业扩张等活动驱动）通过促进生态失衡，导致物种迁移和接触新病原体，从而助长了这些疾病的发生。气候变化也在此过程中发挥关键作用，改变微生物和媒介的分布模式，直接影响宿主与感染性病原体之间的互动动态。
一个值得注意的复杂互动例子是耳念珠菌菌（Candida auris, Candidozyma auris），一种新兴的多药耐药真菌。近期假说认为，该酵母可能起源于温暖、含盐环境中的植物腐生菌，逐渐发展出耐热性和耐盐性。这些特性可能使其最初适应鸟类（特别是沿海环境的鸟类），随后定植于人类。此外，耳念珠菌菌（C. auris）已发展出多种抗真菌耐药机制，由于治疗失败率上升和现有治疗选择效果有限，引起了越来越多的关注。因此，这一潜在进化途径强调了关注环境变化及其如何塑造真菌适应性的必要性。
在此背景下，耳念珠菌菌（C. auris）仅是念珠菌属（Candida）中多样物种的一种，该属包含超过200个代表物种。其中，白念珠菌（C. albicans）是最著名的病原体，已在多种宿主中被鉴定为微生物群的组成部分或感染过程的参与者。此外，它表现出多种特征明确的毒力因子，因此被世界卫生组织（WHO）优先真菌病原体清单收录，强调其对全球公共卫生的重大威胁。过去几十年，非白念珠菌（non-albicans Candida）物种也从人类感染和家养动物中被分离，且抗真菌耐药性报告日益增多，突显了它们在“One Health”（One Health）背景下作为重要新兴病原体的地位。
关于动物微生物群的研究有助于更深入地理解微生物在不同生物体中的生态学和作用。例如，在鸟类中分离和鉴定隐球菌属（Cryptococcus spp.），在蝙蝠中分离荚膜组织胞浆菌（Histoplasma capsulatum）。此外，其他人畜共患病原体如钩端螺旋体属（Leptospira spp.）和弓形虫属（Toxoplasma spp.）也从野生动物中被分离，证明这些动物作为潜在宿主在“One Health”（One Health）重要病原体传播中的作用。
在此背景下，将“One Health”（One Health）方法作为哺乳动物中念珠菌属（Candida）综合监测的框架至关重要。对具有人畜共患潜力（一些为多药耐药且能适应多种宿主）的物种的日益识别，表明需要扩大对其生态学、传播途径和对新生态位适应性的研究。整合临床、环境和分子数据的调查可能阐明动物（特别是野生动物）在维持和传播这些酵母菌中的作用，有助于制定更有效的预防策略，并理解真菌作为互联健康系统中的关键要素。
**方法**
本综述遵循PRISMA 2020指南（Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses, PRISMA 2020 Guidelines）。在PubMed、Scopus、SciELO、Web of Science和BVS Veterinária数据库中进行系统检索。对PubMed使用MeSH描述词，如念珠菌属（Candida）或酵母菌（Yeasts）或真菌组（Mycobiome）或真菌病（Mycoses）或真菌感染（Fungal infection）与野生动物（Animals, Wild）或野生动物（Wildlife）或哺乳动物（Mammals）与野生（wild）或野化（feral）或林栖（sylvatic）或自由放养（free-ranging）。对其他数据库进行术语调整。此外，在初步搜索中通过自由布尔运算符确定了10项研究。时间过滤考虑2000年以后的出版物，由于鉴定技术的进步和念珠菌属（Candida）下物种的分类学变化。为了最大化纳入研究数量，保留了历史上属于该属的所有物种，无论最近的命名变更。本综述对所有发现保留了念珠菌属（Candida）名称。
初步筛选由一位评审员进行，随后由两位评审员独立进行全文评估和数据提取。纳入标准包括在野生哺乳动物中鉴定和/或分离念珠菌属（Candida spp.）的研究，无论是作为感染过程中的病原体还是共生微生物群的组成部分。排除标准包括：书籍章节、社论、综述文章和系统综述；非英语、西班牙语或葡萄牙语的研究；仅关注免疫学测定而无病原体分离的研究；主要致力于诊断方法比较且未提供关于真菌发生、生态学或临床表现的新原始数据的研究；未在物种水平上提供哺乳动物宿主分类学鉴定的研究；以及未明确描述在野生哺乳动物中分离或鉴定念珠菌属（Candida）物种的报告。
引用导出至Zotero?参考管理软件进行去重。提取数据组织在标准化电子表格中，包括作者、出版年份、研究地点、鉴定的念珠菌属（Candida）物种、宿主哺乳动物物种、鉴定和确认方法以及其他非念珠菌微生物的共分离情况。动物按分类学分组以促进科学解释。使用GraphPad Prism生成图表。
**结果**
在五个电子数据库中的初始检索共获得6,267条记录。去除1,056条重复后，剩余5,211条独特记录进行筛选。在第一阶段筛选后，根据标题和摘要排除了5,170项研究。随后，对41篇全文文章进行检索和资格评估。根据排除标准排除了17篇报告，最终从精细化检索中获得24项新研究。此外，手动纳入了10项未在数据库特定字符串中捕获但符合所有纳入标准的研究。最终选定34项研究，其中22项涉及动物共生微生物群，12项涉及感染过程。
34项研究聚焦于哺乳动物物种，分类为水生哺乳动物（aquatic mammals, n=9; 26.47%）、偶蹄目（artiodactyls, n=5; 14.70%）、食肉目（carnivores, n=4; 11.76%）、翼手目（chiropterans, n=1; 2.94%）、真盲缺目（eulipotyphla, n=2; 5.88%）、灵长目（primates, n=6; 17.64%）、啮齿目和兔形目（rodents and lagomorphs, n=7; 20.58%）。这些研究共记录了74个不同的哺乳动物物种。
纳入研究的时间分布从2000年到2026年。高浓度出版物出现在2011年（n=5; 14.70%）、2022年（n=4; 11.76%）和2024年（n=4; 11.76%），共占关于野生哺乳动物中念珠菌属（Candida spp.）总证据的38.22%。
地理分布上，研究分布在五大洲。美洲占多数（n=20; 58.82%），主要由美国（n=9; 26.47%）和巴西（n=8; 23.53%）领导，还有阿根廷、哥伦比亚和特立尼达和多巴哥（各n=1; 2.94%）。欧洲紧随其后，有7项研究（20.59%），主要来自意大利（n=3; 8.82%）、英国（n=2; 5.88%）、克罗地亚（n=1; 2.94%）和俄罗斯（n=1; 2.94%）。亚洲和中东地区有5项研究（14.71%），包括中国（n=2; 5.88%）、沙特阿拉伯、巴基斯坦和泰国（各n=1; 2.94%）。非洲大陆有2项研究（5.88%），来自南非和喀麦隆。
关于念珠菌属（Candida），在选定研究中鉴定了21个物种，尽管在一些出版物中（n=7; 20.58%）未在物种水平报告鉴定。实验室策略评估显示，微生物培养是最常见的初次分离方法，在28项研究（82.35%）中报告。表型和生化特征鉴定（整合传统生化测定、表型测试、商业API
?试剂盒和自动化Vitek
? 2系统）在14项（41.17%）研究中采用。分子技术包括聚合酶链式反应（PCR, n=10; 29.41%）和基因测序（n=9; 26.47%）。通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS, n=4; 11.76%）进行蛋白质组鉴定。组织病理学和细胞学等补充诊断方法在8项（23.52%）工作中进行，而2项（5.88%）研究未提供实验室协议的详细信息。
在仅关注微生物群的研究中（n=22），最常见的采样部位是胃肠道（包括肛门/直肠拭子、粪便样本、鸟粪或食团，n=14; 63.64%）和口腔（n=9; 40.91%）。呼吸道表面通过鼻腔黏膜（n=7; 31.82%）和喷气孔拭子（n=7; 31.82%）进行评估。皮肤病系统（皮肤、毛发和刺）样本在3项研究（13.65%）中报告。其他部位包括生殖道（n=2; 9.09%）、肺组织（n=1; 4.55%）、眼表面（n=1; 4.55%）和胃液（n=1; 4.55%）。
白念珠菌菌（C. albicans）是微生物群报告中最常见的物种，在12项调查（54.55%）中鉴定。其他频繁分离的分类群包括热带念珠菌（C. tropicalis, n=7; 31.82%）、近平滑念珠菌（C. parapsilosis, Lodderomyces parapsilosis, n=6; 27.27%）和吉利蒙念珠菌（C. guilliermondii, Meyerozyma guilliermondii, n=4; 18.18%）。克柔念珠菌（C. krusei, Pichia kudriavzevii）、光滑念珠菌（C. glabrata, Nakaseomyces glabratus）、法玛念珠菌（C. famata, Debaryomyces hansenii）、皱褶念珠菌（C. rugosa, Diutina rugosa）和葡萄牙念珠菌（C. lusitaniae, Clavispora lusitaniae）各在3项研究（13.64%）中记录。几种物种仅在1项研究（4.55%）中报告，包括解脂念珠菌（C. lipolytica, Yarrowia lipolytica）、正滑念珠菌（C. orthopsilosis）、土生念珠菌（C. humicola, Vanrija humicola）、集胞念珠菌（C. colliculosa, Torulaspora delbrueckii）、木兰念珠菌（C. magnoliae, Entelexis paramagnoliae）、齐藤念珠菌（C. saitoana, Suzukiozyma candida）、发酵念珠菌（C. fermentati, Meyerozyma caribbica）、朗比念珠菌（C. lambica, Pichia fermentans）、间滑念珠菌（C. metapsilosis）和清酒念珠菌（C. sake, Fermentozyma sake）以及斯鲁菲念珠菌（C. slooffiae, Kazachstania slooffiae）。
关于物种鉴定，50%的微生物群调查（n=11; 50.00%）仅报告为念珠菌属（Candida spp.）。然而，在报告模式上存在差异：在5项研究（22.73%）中，念珠菌属（Candida spp.）是唯一的分类学名称，未达到物种水平鉴定；而在其余6项研究（27.27%）中，报告了未鉴定的念珠菌菌株以及其他成功鉴定的物种。
至于与感染过程相关的研究（n=12），白念珠菌菌（C. albicans）是最常见的物种，在12项调查中的8项（66.67%）中鉴定。其次是齐氏念珠菌（C. zeylanoides, Dujonia zeylanoides, n=2; 16.67%）和解脂念珠菌（C. lipolytica, n=1; 8.33%），而两项研究（16.67%）未指定涉及的念珠菌属（Candida）物种。
与念珠菌感染相关的临床表现多样且常严重。口腔和上消化道病变突出，包括坏死性舌炎、口腔炎、溃疡性咽炎和食管炎症。皮肤受累也常见，表现为真菌性皮炎、溃疡性或脱屑性病变、红斑性斑块和脱毛。其他局部表现包括真菌性鼻炎、溃疡性角膜炎和坏死性肾盂肾炎。在几个病例中记录了系统性或全身性感染，伴有肺、肝、脾和肾脏中的微小脓肿，常导致死亡。
值得注意的是，仅5项报告（41.67%）描述了念珠菌属（Candida spp.）的独家分离。在大多数病例中（n=7; 58.33%），作者报告了其他病原体或潜在疾病的存在。这些包括其他真菌（如曲霉属（Aspergillus spp.）、新型隐球菌（Filobasidiella neoformans var. neoformans, Cryptococcus neoformans）、马拉色菌属（Malassezia sp.）、肺孢子菌属（Pneumocystis sp.）和须毛癣菌（Trichophyton mentagrophytes））和细菌（如葡萄球菌属（Staphylococcus sp.）、大肠杆菌（Escherichia coli）、梭菌属（Clostridium sp.）和空肠弯曲菌（Campylobacter coli））。此外，还鉴定了病毒共感染，如犬瘟热病毒（Canine Distemper Virus, CDV）和猪圆环病毒2型，以及吸虱Neohaematopinus sciuri的侵扰。
在总研究中，有5项（14.70%）进行了抗真菌敏感性测试，评估了多烯类、唑类、棘白菌素类和嘧啶类似物类别的药物。敏感性谱在不同样本间差异显著。虽然一项研究报告了对所有测试药物（包括多烯类、唑类和棘白菌素类）的100%敏感性，但在四项研究中鉴定了一定程度的敏感性降低或耐药性。对唑类衍生物（特别是氟康唑和伊曲康唑）的耐药性是最常见的发现，某些菌株对该类别中多达四种不同药物不敏感。尽管大多数报告中，对两性霉素B和棘白菌素类（卡泊芬净、米卡芬净和阿尼芬净）的敏感性通常保持，但一项研究记录了涵盖所有测试抗真菌类别的广泛低敏感性谱。
在34项研究中，有11项（32.35%）讨论了与念珠菌属（Candida spp.）存在相关的环境和人为因素。这些因素被分类为：（1）人为压力和残留物，包括接触人类垃圾、城市污染和人类废物污染；（2）农业和工业影响，强调农业中使用的唑类、石油和天然气勘探以及工业径流；（3）圈养和管理条件，其中饮食、抗生素使用和环境应激与微生物多样性丧失和共生真菌组变化相关。一项研究（2.94%）报告称，由于样本量小，无法从现有相关性和统计分析中得出关于生物学和生态学变量影响的可靠结论，并强调需要进一步研究。
**讨论**
本综述揭示了念珠菌属（Candida）酵母菌在74种野生哺乳动物物种中普遍且多样化的存在，范围从极地到热带环境。尽管已知这些酵母菌存在于动物中，但兽医医学似乎仍然低估了真菌，特别是本属，作为潜在的新兴病原体。它们经常被忽视，而优先考虑其他微生物，如细菌和病毒。这些数据表明涉及野生动物以及这些真菌生态学作用（既作为共生微生物群的组成部分，又作为各种感染过程中的病理因子）的研究匮乏。
值得注意的是，大多数涉及野生动物中念珠菌属（Candida）的研究集中在鸟类物种。这一趋势可能与样本采集的便利性、在某些鸟类物种中观察到的更高耐热性以及经典真菌病（如城市鸽子的隐球菌病）的相关性有关。然而，并非所有念珠菌属（Candida）物种都耐热，这限制了它们在恒温宿主中的致病性。
出版物的增加，特别是2022年至2024年间，与全球对真菌病原体认识的提高相吻合，这得益于世界卫生组织（WHO）真菌优先病原体清单。同时，SARS-CoV-2大流行强调了监测野生动物种群及其组成微生物群落的重要性。因此，使用MALDI-TOF和测序的真菌鉴定技术取得了显著进步，同时真菌学领域的兴趣也在增长。
研究在美国（n=9; 26.47%）和巴西（n=8; 23.53%）的集中反映了先进的研究基础设施和较高的哺乳动物生物多样性。然而，尽管本综述的样本量扩大（n=34），仍存在显著的地理失衡。亚洲（n=5; 14.71%）和非洲（n=5.88%）地区在全球念珠菌属（Candida）生态景观中仍代表性不足。鉴于这些大陆拥有世界上一些最多样化的生态系统，但在野生动物真菌学方面研究严重不足，它们可能代表未发现的念珠菌属（Candida）物种和新兴耐药谱系的“热点”。五大洲哺乳动物宿主和鉴定真菌类群的总体多样性突出了这些酵母菌显著的生态可塑性。
变异性，以鉴定21个不同物种为特征，归因于这些酵母菌在生物体内定植不同生态位的能力，得到显著基因组可塑性和高度适应性代谢谱的支持。这些特征允许快速生理调整以适应不同微环境和营养可用性，最终促进附着和组织侵入。
然而，在宿主免疫抑制或环境应激条件下，这些酵母菌可能变得致病。此外，真正的真菌多样性可能仍被低估；近50%的微生物群调查仅达到属水平鉴定（念珠菌属（Candida spp.）），这通常是由于传统表型方法在区分隐存物种方面的局限性。这一分类学差距可能表明，鉴定的21个物种仅代表这些动物实际真菌组的一部分。研究人员也建议，这种定义的缺失可能掩盖新物种或新兴物种的存在，这些物种仍隐藏在通用名称下。
由念珠菌属（Candida）引起的感染主要是继发性的，当宿主平衡被破坏时出现。如选定研究中观察到的，与其他病原体（如猪圆环病毒和须毛癣菌）的共分离与触发显著菌群失调的因素（如环境应激、营养不足和抗菌治疗）的作用一致。这些自然微生物群的变化减少了细菌竞争，有利于酵母菌的定植和组织侵入。在此背景下，念珠菌属（Candida）的存在常作为免疫脆弱性的标志，真菌利用宿主虚弱状态加剧临床病情。然而，其机会性并不排除在高脆弱性场景中作为主要病原体的潜力。这种侵袭性的一个明显例子见于Cleff等人（2008）的报告，其中白念珠菌（C. albicans）在皮肤病变和多个内脏器官中作为单一感染源被分离。从无菌部位和以播散模式分离真菌，且无其他感染因子，表明白念珠菌（C. albicans）的毒力与内在宿主因素相结合，足以克服免疫屏障并引起致命性系统性念珠菌病。
白念珠菌菌（C. albicans）仍然是微生物群和病理过程研究中最常见鉴定的物种。这一发现可能反映了全球对该物种的兴趣，以及用于其鉴定的实验室测试的特异性和简便性。尽管如此，其他物种如克柔念珠菌（C. krusei）和热带念珠菌（C. tropicalis）已在住院人类患者感染中被描述，光滑念珠菌（C. glabrata）和近平滑念珠菌（C. parapsilosis）也在狗和猫中被描述。有趣的是，在已发表的临床报告中，齐氏念珠菌（C. zeylanoides）是仅次于白念珠菌（C. albicans）的第二个最常见分离物种，特别在水生动物物种中。数据库中的定向搜索显示，关于该物种的相关出版物主要涉及动物源性产品和生物技术应用。
一个特别令人担忧的发现是耳念珠菌菌（Candida auris）在医院环境外的出现。尽管最初被认为是一种与医院环境中高死亡率相关的多药耐药人类病原体，但近期证据突出了其在多种野生动物宿主中的存在。值得注意的报告包括从海豚和蛇中分离该物种，暗示其分布比先前理解的更广泛。这种多药耐药病原体在野生种群中的检测代表了一个关键的“One Health”（One Health）里程碑，因为它意味着野生动物可能作为高度耐药谱系的哨兵或潜在宿主，可能由人为环境变化和全球变暖驱动。
本综述中观察到的抗真菌敏感性谱的异质性表明野生哺乳动物种群面临不同水平的环境或人为压力。唑类耐药性的流行是一个特别令人担忧的发现，因为这些化合物不仅用于人类和兽医医学，还作为农业实践中的杀菌剂。在搜索中，分析该动物种群敏感性谱的研究数量非常少，表明数据稀缺，因此提出的假设认为在野生动物分离株中观察到的耐药性可能是环境污染的生物指示剂。显示完全敏感性（Brustenga等人，2025）与报告多药耐药性（Castelo-Branco等人，2013；Rhimi等人，2022）的研究之间的对比突显了暴露梯度：在更受保护的栖息地中的动物可能携带敏感菌株，而处于人类改变环境或康复中心中的动物可能作为耐药菌株的宿主。
气候变化和人为行动，如森林砍伐、栖息地破碎化、农药使用和日益城市化，直接影响动物微生物群的组成和稳定性。这些环境变化创造了生态失衡的条件，可能促进机会性微生物的生长或诱导更具耐药性菌株的选择。在真菌中，这一现象已在多种情况下被记录，表明酵母菌能快速响应变化的环境条件。
在此背景下，念珠菌属（Candida）的酵母菌也可能作为环境质量的指标。一些菌株抗真菌敏感性谱的变化可能反映环境中化学残留物（如农药、重金属和农业抗真菌剂）的存在。在本综述纳入的研究中，Rhimi等人（2022）的研究突出：作者评估了从野猪获得的菌株，并观察到对主要测试抗真菌剂没有耐药性。他们表明这种敏感性指示了无显著化学污染的环境，将这些酵母菌定位为保存环境的潜在标记。这种方法尽管仍未被充分探索，但有助于加强环境真菌学作为生态监测工具，允许在缺乏宿主临床改变的情况下推断选择性压力。
进行本系统综述揭示了研究野生动物中念珠菌属（Candida）固有的显著挑战。一个主要障碍是专门针对野生哺乳动物种群的研究总体匮乏，这通常伴随着缺乏标准化鉴定方案和地理数据收集差异。尽管如此，这些局限性强化了通过整合临床、分子和生态数据的综合方法扩大真菌学研究的重要性。对野生动物真菌微生物群的主动监测应被视为环境保育、生物安全和“One Health”（One Health）策略的基本组成部分。此外，关于抗真菌耐药性和毒力因子的菌株特征描述对于绘制受人为影响较大的区域和预测潜在威胁（对公共和动物健康）至关重要。
**结论**
本系统综述揭示了念珠菌属（Candida）是野生哺乳动物真菌组中普遍且高度适应的组成部分，在不同生态位中鉴定了21个不同物种。虽然白念珠菌（C. albicans）仍是主要分类群，但广泛非白念珠菌物种的鉴定突出了显著的生态可塑性。然而，未鉴定分离株的高频率（50%）和显著的地理失衡，特别是缺乏来自非洲和亚洲的数据，表明我们对野生动物真菌学的理解仍然碎片化。为了从机会性报告过渡到结构化全球监测模型，必须超越传统表型方法，采用MALDI-TOF MS或内转录间隔区（ITS）区域测序作为最低鉴定标准。此外，未来研究必须优先整合使用最小抑菌浓度（MIC）测定法结合标准化国际折点（CLSI或EUCAST）的抗真菌敏感性测试（AST），以确保数据可比性。方法学协调同样至关重要，包括使用扩增子测序来表征逃逸传统培养依赖技术的真菌群落。通过解决这些差距并将野生动物数据整合到“One Health”（One Health）监测框架中，科学界可以更好地监测人为压力如何影响真菌多样性，并有效绘制念珠菌属（Candida）在自然环境中的生态动态。
