琥珀酰化相关基因特征有助于乳腺癌患者的风险分层与预后预测建模

《Amino Acids》：Succinylation related gene signature enables risk stratification and prognostic modeling in breast cancer patients

　　

摘要

乳腺癌（BRCA）是女性面临的主要健康威胁，且预后通常较差。琥珀酰化与癌症代谢密切相关，但针对BRCA中的琥珀酰化相关基因（SRGs）的研究仍相对有限。本研究首先在TCGA队列中识别出正常组与BRCA组之间差异表达的基因，并将这些基因与已知的SRGs进行交叉分析，从而得到差异表达的SRGs（DE-SRGs）。通过单变量Cox回归和LASSO Cox回归分析对DE-SRGs进行筛选，随后再利用多变量Cox回归构建与琥珀酰化相关的预后模型。根据中位数得分，患者被分为高琥珀酰化相关风险评分组与低琥珀酰化相关风险评分组，接着比较两组在免疫微环境特征、体细胞突变负荷以及药物敏感性方面的差异。此外，还通过qRT-PCR验证了这些关键基因的表达水平。本研究基于13个SRGs（ACOT4、ALDH3A1、B3GALT1、IFNG、MMP1、NFKB2、PCSK6、PTK2、SERPINA1、SHMT2、SIRT7、ST3GAL1和SUCLA2）为BRCA患者建立了预后风险模型。低SRS组中免疫细胞的浸润程度显著更高，包括B细胞、肥大细胞和巨噬细胞；该组的肿瘤突变负荷也明显更低。药物敏感性分析表明，高SRS的BRCA患者可能对FTI-277和GNF-2更为敏感。qRT-PCR结果显示，在人类BRCA细胞系中，ACOT4、IFNG、MMP1、NFKB2、PCSK6、PTK2、SHMT2、SIRT7和ST3GAL1的表达显著上调，而ALDH3A1、B3GALT1和SUCLA2的表达则显著下调。我们的研究结果凸显了SRGs在BRCA诊断中的预后价值，为将其用于指导个性化治疗奠定了基础。