《Signal Transduction and Targeted Therapy》:Dual-targeting pharmacological UFMylation inhibition reprograms tumor and immune microenvironments to achieve long-term glioblastoma regression
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UFMylation是一种新近发现的类泛素(ubiquitin-like)修饰,对细胞应激稳态至关重要,尤其在内质网(endoplasmic reticulum, ER)应激调控中发挥作用。然而,由于缺乏强效小分子抑制剂,其生物学与治疗学探索一直受阻。在此,研
UFMylation是一种新近发现的类泛素(ubiquitin-like)修饰,对细胞应激稳态至关重要,尤其在内质网(endoplasmic reticulum, ER)应激调控中发挥作用。然而,由于缺乏强效小分子抑制剂,其生物学与治疗学探索一直受阻。在此,研究人员报道了首个靶向UFMylation E3连接酶复合物核心蛋白DDRGK1的两个化合物发现:Osimertinib(最初设计为EGFR T790M选择性抑制剂,通过此前未被识别的共价机制起作用)和CP-24(一种新型非共价抑制剂)。两个化合物均破坏DDRGK1–UFL1相互作用,全局抑制UFMylation,抑制ER-自噬(ER-phagy),并诱导ER应激。在胶质母细胞瘤(glioblastoma, GBM)中,药理学UFMylation抑制显著降低肿瘤细胞活力,并使细胞对替莫唑胺(Temozolomide)与放疗增敏。两个化合物还具有强免疫调节活性,促进巨噬细胞向抗肿瘤M1状态极化。在体内,Osimertinib凭借更优的药代动力学特征,在免疫缺陷模型中显著抑制肿瘤生长,并在65%的免疫健全小鼠中实现无肿瘤结局。这些无肿瘤小鼠形成持久的抗炎GBM免疫记忆,在再次攻击时迅速清除肿瘤,这是既往GBM治疗无法实现的结局。机制上,Osimertinib通过促进巨噬细胞M1极化、T细胞扩增以及降低PD-1蛋白水平来增强抗肿瘤免疫。综上,研究人员的研究将Osimertinib和CP-24引入作为解析UFMylation生物学的宝贵化学探针,并强调Osimertinib在EGFR野生型GBM中超说明书使用的潜力。更广泛地,研究人员确立UFMylation抑制作为一种双靶向治疗策略,可同时破坏肿瘤生存通路并重编程免疫微环境,为GBM持久控制提供有前景的途径。
研究背景方面,UFMylation作为类泛素修饰,通过E1(UBA5)、E2(UFC1)、E3(UFL1–DDRGK1–CDK5RAP3)级联催化UFM1与底物结合,维持内质网应激与ER?phagy等蛋白稳态,但其缺乏高效特异性小分子抑制剂限制了功能与治疗研究。胶质母细胞瘤(GBM)五年生存率低于3%,标准手术、放疗、替莫唑胺(TMZ)、肿瘤治疗电场疗效有限且易耐药,亟需新策略。遗传学提示UFMylation组分(UBA5、UFC1、UFL1)参与GBM存活、放化疗抵抗与免疫逃逸,具促癌属性,药理学靶向具潜力。本研究由研究人员开展,旨在发现靶向DDRGK1–UFL1互作的抑制剂,验证Osimertinib与CP?24在GBM中对UFMylation的抑制、抗肿瘤与免疫重编程效应,并探明机制与在体疗效。结论表明两化合物通过结合DDRGK1破坏E3组装,抑制全局UFMylation、阻断ER?phagy、诱导ER应激,在体外杀伤GBM并增敏TMZ与放疗,促进巨噬细胞M1极化;Osimertinib在免疫健全小鼠实现约65%完全消退与长期免疫记忆,机制含M1极化、T细胞扩增与PD?1下调。意义在于首次将已上市Osimertinib重新界定为UFMylation抑制剂,为EGFR野生型GBM提供可快速转化的超说明书思路,并将UFMylation抑制确立为同时靶向肿瘤与免疫的双靶向策略,论文发表于《Signal Transduction and Targeted Therapy》。
关键方法上,研究人员采用基于NanoBRET的高通量筛选联合Schr?dinger Maestro虚拟筛选从化合物库鉴定DDRGK1–UFL1互作抑制剂;通过等温滴定量热(ITC)、共免疫沉淀(co?IP)、Q?TOF MS与分子对接验证结合与共价修饰位点;在A172、LN229、U251、U87细胞及GBM322等患者来源细胞评估UFMylation、ER?phagy(mCherry?EGFP?RAMP4系统)、ER应激(bulk RNA?seq)、细胞死亡与TMZ/放疗增敏;用THP?1来源与原代骨髓巨噬细胞检测M1极化;在NCG小鼠U87原位、BALB/c裸鼠GBM375患者来源异种移植、C57BL/6J小鼠GL261同基因模型中口服Osimertinib(10 mg/kg)评估肿瘤负荷(生物发光成像)、生存与免疫表型(流式细胞术分选肿瘤浸润CD45+免疫细胞),并进行28周后肿瘤再攻击实验评估免疫记忆;转录数据分析采用CGGA、GEPIA、TCGA队列与DepMap药物敏感性数据。
研究结果部分,Identification of Osimertinib and CP?24 as potent disruptors of the DDRGK1?UFL1 interaction:研究人员构建NanoBRET体系筛选并虚拟富集,发现Osimertinib与CP?24剂量依赖性抑制DDRGK1?UFL1蛋白?蛋白相互作用(PPI),被选为候选抑制剂。Binding of Osimertinib and CP?24 to DDRGK1:ITC显示两化合物直接结合DDRGK1Δ216–314而不结合UFL1Δ1–212,预孵育后抑制DDRGK1Δ216–314与UFL1Δ1–212结合;co?IP证实细胞内降低DDRGK1?UFL1共沉淀;MS显示Osimertinib共价修饰DDRGK1Δ216–314的Ser226、Lys227、Thr217,CP?24为非共价结合;分子对接阐明各自结合模式,共价结合解释更强NanoBRET抑制。Impact on UFMylation and ER stress induction:在多株GBM细胞中,两化合物剂量依赖性降低全局UFM1偶联蛋白与DDRGK1蛋白水平;mCherry?EGFP?RAMP4系统显示抑制饥饿诱导ER?phagy;共表达dTomato?DDRGK1与EGFP?UFL1可见聚集体减小并出现内质网涡旋样结构(ER whorl?like structures);RNA?seq与qRT?PCR显示HSPA5、sXBP1、ERN1、EIF2AK3、CANX、ATF4、DDIT3等ER应激基因上调;其他EGFR/MNK2抑制剂不重现上述效应,表明作用不依赖已知靶点。Pleiotropic anti?tumor effects in vitro:CGGA、GEPIA、TCGA显示DDRGK1高表达与GBM患者生存负相关且与WHO分级、年龄正相关;shRNA敲低DDRGK1/UFL1抑制增殖,过表达促进;两化合物剂量依赖性降低GBM细胞系与患者来源细胞活力,DDRGK1过表达挽救死亡;RNA?seq示凋亡基因(CASP1、CASP4、CASP8、CASP9、CASP10、BAX、TP53、PTEN、FAS)上调,增殖基因(KI67、CCND1、CCND2、CCND3、CDK2、CDK6、CDK10、CDK15、MTOR)下调;EGFRvIII表达不挽救死亡,磷酸化EGFR Y1068抑制与死亡无对应,DepMap显示敏感度关联DDRGK1而非EGFR/MKNK2;TMZ耐药与放疗后细胞对两化合物更敏感,RNA?seq示DNA修复基因(ATR、RAD51、DDB1、DDB1、CHEK1、MSH2、PCNA、RPA1、SMC3、DCLRE1B)下调;两化合物在THP?1与原代骨髓巨噬细胞中上调M1标记(CD68、CD86、CD80、ITGAX、CXCL16),不改M2(TGFB1)。Pleiotropic anti?tumor effects in vivo:药代显示Osimertinib脑暴露优于CP?24;在NCG U87原位与BALB/c裸鼠GBM375模型,口服10 mg/kg Osimertinib显著降低肿瘤负荷并延长生存且无体重影响;在C57BL/6J GL261同基因模型,约65%小鼠完全消退,10/14长期无瘤;流式示外周血与肿瘤浸润中CD80+髓系细胞(M1)增加,CD3+CD4+ T细胞增多,肿瘤浸润CD3+CD8+与CD3+CD4+ T细胞PD?1蛋白水平下降;免疫印迹示肿瘤细胞和各类免疫细胞中全局UFMylation均被抑制。Long?term immune memory and prevention of glioblastoma recurrence:28周后在初始对侧再接种GL261?luc,曾无瘤小鼠6日内无进展,14日内完全清除;再攻击2日后CD8+CD44+CD62L?效应T、CD8+CD44+CD62L+中央记忆T、CD4+CD44+CD62L?效应T扩张,CD8+CD44?CD62L+与CD4+CD44?CD62L+初始T减少,证明持久免疫记忆防复发。
讨论部分总结:研究人员讨论中指出,Osimertinib与CP?24通过靶向DDRGK1?UFL1抑制UFMylation,在GBM中兼具直接致死、ER应激、免疫重编程(M1极化、T细胞扩增、PD?1下调)与长期免疫记忆,65%免疫健全小鼠完全消退为既往疗法未及;Osimertinib在EGFR野生型GBM中通过共价结合DDRGK1起效,独立于突变EGFR抑制,提示可拓展至更广GBM人群超说明书使用;CP?24需优化药代与脑渗透;GBM异质性决定单药难持久,但两化合物增敏TMZ/放疗并降PD?1,可联合标准治疗与免疫检查点阻断,并以DDRGK1表达与IDH状态分层;不能完全排除微量脱靶与EGFR协同,需全景蛋白质组排查;总体而言,研究确立UFMylation驱动GBM进展,抑制其为双靶向策略,并为已上市药再定位与新一类UFMylation导向治疗奠基。研究结论部分译为:在本研究中,研究人员将Osimertinib和CP?24鉴定为靶向DDRGK1?UFL1相互作用的有效UFMylation抑制剂。两化合物抑制全局UFMylation,降低DDRGK1蛋白水平,损害ER?phagy,诱导深度ER应激,触发肿瘤细胞死亡并调节免疫反应。在原位模型中,Osimertinib在免疫缺陷宿主中显著抑制肿瘤生长,并在65%免疫健全小鼠中实现完全、持久消退——伴随再攻击时强健的抗GBM免疫记忆,这是先前治疗无法达成的。这反映双靶向机制:通过ER应激诱导凋亡直接杀瘤,以及强效重编程免疫微环境(包括M1巨噬细胞极化、T细胞扩增、肿瘤浸润T细胞PD?1下调),将免疫“冷”GBM转为活跃病灶。值得注意的是,Osimertinib通过此前未被识别的靶向DDRGK1的共价机制在EGFR?WT GBM中发挥这些效应,独立于其对突变EGFR的经典活性。然而迄今为止,Osimertinib在GBM中的临床评估主要限于EGFR突变背景。鉴于其抑制UFMylation、降低与生存负相关的DDRGK1、诱导ER应激并同时调控肿瘤细胞死亡与免疫微环境,Osimertinib成为包括EGFR?WT在内、缺乏有效靶向治疗的更广大GBM患者再定位的有前景候选;因此该治疗假说值得前瞻性、生物标志物指导的临床研究。尽管CP?24在体外有效,但其药代需进一步优化以提升潜力,仍可作为有价值化学探针与非共价UFMylation抑制剂新骨架。GBM仍极难治愈,尚无单药实现持久生存获益;其遗传、表观与环境异质性驱动快速适应耐药与克隆选择,Osimertinib虽在模型中有效但单药不大可能克服所有障碍。数据提示可联合TMZ与放疗(两化合物增敏、下调DNA修复、降PD?1),并以DDRGK1表达与IDH状态分层,采用适应性设计与治疗中活检监测耐药。虽数据支持UFMylation抑制为Osimertinib抗GBM核心驱动,但不能完全排除其他解释:其在微摩尔浓度下报道有微弱脱靶激酶(如MNK2)抑制,但对应选择性抑制剂不重现UFMylation抑制与细胞毒,且敏感度不与已知靶点转录相关,提示贡献微小;GBM细胞或对EGFR信号与UFMylation具双重依赖,不能排除EGFR抑制与UFMylation抑制协同可能;共价弹头或与DDRGK1外亲核残基反应,需全面无偏蛋白质组界定潜在脱靶以优化剂量与安全转化。这些可能不削弱UFMylation抑制为GBM可行动脆弱性的核心结论,但凸显第二代非共价抑制剂(如CP?24衍生物)与目标去卷积研究对未来临床转化特异性的价值。综上,结果确立UFMylation在推动GBM进展中的关键作用,并强调UFMylation抑制为同时影响肿瘤与免疫应答的双靶向策略;通过揭示已上市药物在占多数的EGFR?WT亚型中强效、EGFR非依赖活性,本工作提供即时再定位机会,并为新型UFMylation导向治疗奠定基础。