《Nature Communications》:Mechanism of actin thin filament pointed-end elongation by leiomodin
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在非肌肉细胞中,肌动蛋白丝表现出可变长度和快速周转,亚基主要在 barbed end(尖端)添加。在横纹肌肌小节中,情况显著不同,尽管快速周转,肌动蛋白细丝表现出均匀长度,并且亚基主要在 pointed end(尖端)交换。这种细丝长度均匀性由多种蛋白质严格调
在非肌肉细胞中,肌动蛋白丝表现出可变长度和快速周转,亚基主要在 barbed end(尖端)添加。在横纹肌肌小节中,情况显著不同,尽管快速周转,肌动蛋白细丝表现出均匀长度,并且亚基主要在 pointed end(尖端)交换。这种细丝长度均匀性由多种蛋白质严格调控,包括骨骼肌中的分子尺 nebulin,以及骨骼肌和心肌中的 barbed-end 和 pointed-end 加帽蛋白 CapZ 和 tropomodulin(Tmod)。近年来在细胞和动物模型中的研究已将 leiomodin-2(Lmod2)确定为一种额外的调控因子,提议其促进 pointed-end 延伸以维持细丝长度。这种活性将使 leiomodin 成为唯一已知的驱动 pointed-end 延伸的真核因子,然而其分子机制仍未解明。在此,研究人员展示了一系列冷冻电镜结构,这些结构支持一种逐步延伸机制,其中两个 Lmod2 分子在 pointed end 交替,同时招募肌动蛋白单体。这些发现建立了肌肉肌小节中 pointed-end 延伸的分子基础,并为理解导致扩张型心肌病的 Lmod2 突变提供了框架。
论文解读文章
研究背景:在非肌肉细胞中,肌动蛋白丝主要通过 barbed end(尖端)添加ATP-肌动蛋白亚基进行组装,而通过 pointed end(尖端)解离ADP-肌动蛋白进行解聚,这种内在动力学不对称性由多种蛋白调控。然而,在横纹肌肌小节中,尽管亚基快速周转,肌动蛋白细丝却呈现出显著均匀的长度,且亚基交换主要发生在 pointed end。这种长度均匀性由多种蛋白严格调控,包括骨骼肌中的分子尺 nebulin、barbed end 加帽蛋白 CapZ 以及 pointed end 加帽蛋白 tropomodulin(Tmod)。近年细胞和动物模型研究将 leiomodin-2(Lmod2)鉴定为一种额外的调控因子,可能促进 pointed-end 延伸以维持细丝长度。若此活性成立,Lmod2 将成为唯一已知驱动 pointed-end 延伸的真核因子,但其分子机制一直未解。因此,本研究旨在阐明 Lmod2 介导的 pointed-end 延伸的分子基础,为理解其失活导致扩张型心肌病等疾病提供结构框架。
研究人员开展的研究:通过冷冻电镜(cryo-EM)解析一系列结构,结合伴生的单分子微流控全内反射荧光(mf-TIRF)显微镜分析,揭示了 Lmod2 逐步延伸 pointed-end 的分子机制。结论指出,两个 Lmod2 分子交替结合 pointed end,同时招募肌动蛋白单体,实现持续延伸。这一发现建立了肌肉肌小节中 pointed-end 延伸的分子基础,解释了 Lmod2 突变导致细丝长度异常并引发扩张型心肌病的机制。论文发表在《Nature Communications》。
主要关键的技术方法:研究人员从兔骨骼肌纯化 α-肌动蛋白和 tropomyosin(Tpm1.1);将全长人 Lmod2 克隆至 pTYB1 载体,在 ArcticExpress(DE3)细胞中表达并纯化;将人 CapZ 亚基 α1 和 β2 共表达于 pRSFDuet-1 载体并纯化。制备含肌动蛋白、CapZ、Tpm1.1 和 Lmod2 的样品,在 F-buffer 中聚合,经 CapZ 加帽 barbed end 以增加 pointed end 数量。使用 FEI Titan Krios 显微镜(300 kV)和 Gatan K3 探测器采集 cryo-EM 数据。采用单颗粒方法及 helical reconstruction 处理数据,获得 mid-filament 结构(约2.0 ?分辨率)及五种 pointed-end 结构(free PE、one-Lmod2、one-Lmod2+actin、two-Lmod2+actin)。模型构建和精修在 Coot 和 Phenix 中进行。
研究结果(保留每个小标题并简要说明通过什么研究得出什么结论):
**Lmod2与Tmod1在PE结合结构的异同**:通过比较 Lmod2 和 Tmod1 在 pointed end 的 cryo-EM 结构,研究人员发现两者均通过 LRR(亮氨酸富集重复结构域)结合于前三个亚基(P、P-1、P-2)之间,但 Lmod2 的 DBS(D环结合位点)稳定了 P-1 的 D-loop(D环),其构象与 mid-filament 亚基不同。Lmod2 的 LRR 结合使 P 亚基整体旋转约6°偏离丝轴,P-1 则呈现近 F-actin 构象。与 Tmod1 不同,Lmod2 缺乏完整的 ABS1(肌动蛋白结合位点1),使得 pointed end 暴露,有利于亚基添加。此外,Tpm 未在 Lmod2 结合的 PE 中观察到,可能因其单 TMBS(原肌球蛋白结合位点)和短丝长度所致。
**两个Lmod2分子在PE和肌动蛋白亚基招募**:在 one-Lmod2+actin 结构中,额外亚基 P+1 被招募到 pointed end,与 P、P-1 及 Lmod2 的 LRR 接触。Lmod2 的 DBS 插入 P+1 的 H-cleft,功能上模拟 D-loop 以促进招募。此时 LRR 接触四个肌动蛋白亚基。在 two-Lmod2+actin 结构中,第二个 LRR 结合于丝对侧,与 P+1、P、P-1 相互作用,使 P+1 旋转约6.5°,P 呈现中间构象,P 的 D-loop 被第二个 DBS 稳定。这些结构表明,两个 Lmod2 交替结合,驱动亚基逐步添加与构象变化。
**延伸模型与总结**:基于上述结构及生化数据,研究人员提出多步延伸机制:首先,Lmod2 的 LRR 结合 PE,稳定热运动产生的高能态;其次,开放结合位点招募肌动蛋白亚基;第三,第二个 LRR 结合,引发旋转和构象过渡;最后,第一个 LRR 被空间位阻取代并解离,重置 PE 进入下一循环。C 端 WH2 结构域(含 WH2 结构域)可能通过瞬时结合丝侧维持持续性。一旦细丝达到生理长度,Lmod2 被 Tmod1 在 M 线附近取代。
总结讨论与结论翻译:讨论部分强调,Lmod2 是首个被鉴定的真核 pointed-end 聚合酶,功能上模拟 barbed-end 延伸的 formin 和 Ena/VASP。本工作为肌肉肌小节中 pointed-end 优先添加亚基提供了结构解释,并揭示了 Lmod 亚型突变破坏细丝长度导致肌肉疾病的机制。研究结论翻译如下:上述结果揭示了一种机制,即原先已知具有肌动蛋白聚合成核活性的 Lmod2,可能也作为持续性的 pointed-end 聚合酶发挥作用。尽管细菌蛋白 VopL/VopF 已被报道能进行持续性的 pointed-end 延伸,Lmod2 是目前唯一已知的真核 pointed-end 聚合酶,在功能上模拟真核 formin 和 Ena/VASP 的 barbed-end 延伸。这项工作进一步为肌肉肌小节中 pointed-end 优先添加单体的现象提供了机制解释,并阐明了 Lmod 亚型突变如何因破坏细丝长度而导致肌肉疾病。值得注意的是,AlphaMissense 预测高致病性错义突变聚集在 Lmod2 参与蛋白-蛋白相互作用的区域,包括 TMBS、LRR 和 WH2 结构域,其中 LRR 与肌动蛋白接触的表面突变发生率最高。