对14q12微缺失的分析揭示了与神经发育障碍相关基因FOXG1的新调控位点

《Nature Communications》：Analysis of 14q12 microdeletions reveals novel regulatory loci for the neurodevelopmental disorder-related gene FOXG1

　　

摘要

高达17%的神经发育障碍可由破坏编码区域并导致基因剂量异常的致病变异解释。然而，那些能够干扰顺式调控元件及下游基因表达的非编码变异则研究较少。在本研究中，我们发现了在具有FOXG1单倍体功能不足症状的个体中，与FOXG1基因相关的14q12区域存在多处缺失。研究表明，最小重叠区域的缺失会降低FOXG1的表达，扰乱顺式调控元件，并改变FOXG1在基因组中的相互作用。不过，仅删除最小重叠区域并无法完全消除FOXG1的表达，这说明有多个顺式调控元件共同参与对FOXG1的调控，必须全部删除才能彻底阻止其表达。最小重叠区域缺失后的转录组特征与FOXG1缺失时的特征有部分重叠，包括FOXG1的直接作用靶标，这表明存在相似的分子调控途径。这些发现扩展了FOXG1复杂调控区域的范围，同时也进一步丰富了关于神经发育障碍易感性与调控变异之间的关联认知。