对野生倭黑猩猩的靶向染色体测序在洛马米河以东发现了一个基因上独特的亚群体

《Genome Biology》：Targeted chromosomal sequencing of wild bonobos identifies a genetically distinct subpopulation east of the Lomami river

　　

摘要

背景

倭黑猩猩（Pan paniscus）是一种濒危物种，由于其高质量样本难以获取，多年来在基因研究方面一直较为不足。研究它们的基因组不仅有助于了解其进化历程，还能为保护工作提供支持，包括种群管理、多样性及近亲繁殖程度评估，以及追踪被救个体以打击非法野生动物贸易。

研究结果

本研究利用从156份野生倭黑猩猩粪便样本中通过非侵入性方式获得的21号染色体目标捕获数据，对其种群结构进行了全面分析。我们确认了此前推测的三个亚种群的存在，即西部、中部和东部倭黑猩猩，这些亚种群以洛马米河等自然屏障作为基因流动的隔离带。通过估算近亲繁殖程度、多样性和差异性，我们证实了西部和东部种群相对独立的状况，并进一步了解了它们祖先的扩散路径。我们还推断了这些种群的演化历史，运用遗传学方法对来源不明的样本进行地理定位，结果显示其潜在起源地的精确度可达约50公里。

结论

我们的研究为了解倭黑猩猩的进化过程和种群结构提供了重要见解，揭示了河流如何成为种群之间的重要隔离屏障。同时，该研究也为保护工作提供了依据，强调了需要更密切地监测倭黑猩猩种群，尤其是那些处于孤立状态的种群。

意义

由于倭黑猩猩生活在偏远的森林中且属于濒危物种，其基因研究一直面临诸多困难。本研究通过非侵入性采样和21号染色体目标捕获测序技术，对其种群结构进行了迄今为止最详细的研究。我们发现了三个主要亚种群，且河流屏障对这些种群的遗传差异产生了影响，尤其是位于洛马米河东侧的种群。这些数据有助于确定被没收样本的地理来源，从而为倭黑猩猩的保护工作提供帮助。