RNARL：基于强化学习的多目标RNA密码子设计统一生成框架

《Genome Biology》：RNARL: reinforcement learning-driven unified generative framework for multi-objective RNA codon design

　　

摘要

目前的RNA密码子设计方法存在长序列处理效率低且泛化能力差的问题，通常采用分离式的“生成或优化”模式。我们提出了RNARL，这是一种基于强化学习的框架，可将序列生成与多目标优化相结合。RNARL能够直接学习生成高性能序列，有效优化长度达3,900个核苷酸的序列，并在六种物种和五种RNA类型中展现出优异的性能与通用性。因此，RNARL为RNA密码子设计提供了一个高效且具有泛化能力的框架。此外，我们还提供了用户友好的网络平台，便于将这一技术应用于RNA疗法的设计中。