《Chinese Medicine》:Yiyi Fuzi Baijiang formula protects against DSS-induced colitis by orchestrating the gut barrier-microbiota-metabolism axis
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摘要
背景炎症性肠病(IBD)是一种胃肠道复发性炎症性疾病,全球发病率不断上升。目前的治疗方法常因副作用、疗效丧失和成本高昂而受限,这凸显了开发更安全、更有效的替代疗法(尤其是源自天然产物的多靶点药物)的必要性。
目的本研究旨在阐明薏苡附子败酱散(YFB)(一
摘要
背景炎症性肠病(IBD)是一种胃肠道复发性炎症性疾病,全球发病率不断上升。目前的治疗方法常因副作用、疗效丧失和成本高昂而受限,这凸显了开发更安全、更有效的替代疗法(尤其是源自天然产物的多靶点药物)的必要性。
目的本研究旨在阐明薏苡附子败酱散(YFB)(一种中药(TCM)复方)对葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的急性结肠炎的保护机制,重点关注其对肠道屏障-微生物-代谢轴的系统性调节。
方法研究人员采用了一种整合方法,结合了网络药理学、基于UPLC-Q-TOF-MS/MS的植物化学分析、在DSS诱导的结肠炎小鼠模型中的体内评估、16S rRNA基因测序和非靶向代谢组学,以评估YFB的效果并揭示其作用机制。
结果网络药理学预测并实验证实,YFB的核心成分(例如,槲皮素、山奈酚)通过IL-17、TNF和NF-κB通路发挥作用。YFB给药剂量依赖性地改善了结肠炎小鼠的疾病活动指数、结肠缩短和组织病理学。它通过上调ZO-1、Occludin和MUC2来恢复肠道屏障完整性,同时抑制促炎细胞因子(TNF-α、IL-6、IL-1β、IL-17A)和NF-κB活化。关键的是,YFB通过恢复肠道干细胞标志物LGR5和祖细胞标志物SOX9的表达,并纠正内分泌细胞标志物CHGA的异常增加,从而促进上皮修复。YFB治疗与DSS诱导的肠道菌群失调的逆转、多样性的恢复、有益菌(例如,毛螺菌科Lachnospiraceae)的富集以及机会致病菌(例如,肠杆菌科Enterobacteriaceae)的抑制相关。非靶向代谢组学显示,YFB治疗与DSS改变的粪便代谢物(例如,脂肪酸、胆汁酸)和诸如“不同环境中的微生物代谢”等通路的调节相关。
结论YFB,在与DSS同时给药时,通过其多组分系统的协同效应保护DSS诱导的结肠炎。其机制涉及对肠道屏障-微生物-代谢轴的系统性调节,包括抑制NF-κB驱动的炎症、促进肠道上皮修复(通过LGR5/SOX9/CHGA调节)、恢复肠道屏障、改变肠道菌群以及调节宿主-微生物共代谢。这些发现为YFB的临床应用提供了科学依据,并凸显了中药复方在管理复杂的多因素疾病中的价值。
图形摘要
### 论文解读文章
#### 研究背景与目的
炎症性肠病(IBD)是一种全球发病率持续上升的胃肠道复发性炎症性疾病。当前的一线治疗药物,如氨基水杨酸制剂、皮质类固醇、免疫抑制剂和生物制剂,主要用于抑制过度的免疫反应,但其长期使用常伴随显著的副作用、疗效随时间丧失(应答丧失)以及高昂的经济负担。此外,免疫检查点抑制剂(ICI)相关性结肠炎的出现,进一步凸显了IBD发病机制的复杂性以及现有免疫抑制策略的局限性。因此,迫切需要开发更安全、更有效且成本低廉的替代疗法,特别是源自天然产物的多靶点药物。
IBD的发病机制涉及肠道屏障功能障碍、肠道菌群失调以及宿主-微生物共代谢紊乱,这三者相互作用,形成了“肠道屏障-微生物-代谢”轴。中药(TCM)复方因其多组分、多靶点和协同作用的特性,在此治疗背景下展现出独特优势。薏苡附子败酱散(YFB)源自经典典籍《金匮要略》,传统上用于治疗“肠痈”,其症状与现代IBD高度相似。该方由薏苡仁、炮附子和败酱草三味药组成。尽管已有研究报道了YFB的抗炎活性及其对经典炎症通路和肠道菌群的调节作用,但对其在肠道屏障修复、微生物互作以及多靶点协同作用机制方面的理解仍存在显著空白,尤其是YFB是否以及如何对整个“肠道屏障-微生物-代谢”轴进行系统性调节,这是一个关键且未解决的问题。因此,本研究旨在通过整合现代分析技术与实验方法,系统性地阐明YFB抗结肠炎的整体机制。该研究于《Chinese Medicine》发表。
#### 主要技术方法
研究人员为开展本研究,主要采用了以下关键技术方法:
1. **网络药理学分析**:利用TCMSP、HERB和TCMID数据库筛选YFB的潜在活性成分及其靶点,并与IBD相关基因数据库(GeneCards、OMIM)进行交叉分析,构建蛋白质-相互作用(PPI)网络并进行GO和KEGG通路富集分析。
2. **UPLC-Q-TOF-MS/MS植物化学分析**:对YFB水提液进行超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱分析,鉴定其主要化学成分。
3. **DSS诱导的急性结肠炎小鼠模型体内评估**:使用雄性C57BL/6小鼠,通过饮用3%葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导急性结肠炎,同时灌胃给予不同剂量的YFB,评估其对疾病活动指数(DAI)、结肠长度、组织病理学(H&E染色、PAS染色)的影响。
4. **16S rRNA基因测序**:对小鼠粪便样本进行16S rRNA基因V3-V4区高通量测序,分析肠道菌群的组成、多样性及差异菌群。
5. **非靶向代谢组学分析**:对小鼠粪便样本进行基于UPLC-TripleTOF 5600plus高分辨质谱的非靶向代谢组学分析,鉴定差异代谢物及相关代谢通路。
#### 研究结果
**网络药理学预测YFB治疗结肠炎的核心靶点和通路**
通过筛选,从YFB中获得142个潜在活性化合物,对应192个蛋白靶点。与IBD相关基因(4439个)交叉分析,得到155个重叠靶点。通过PPI网络筛选,确定了10个核心靶点,包括BCL2、HSP90AA1、AKT1、RELA、TNF和IL6等。KEGG通路富集分析显示,这些靶点显著富集于IL-17、TNF和AGE-RAGE等与IBD发病密切相关的信号通路。
**通过UPLC-Q-TOF-MS/MS鉴定YFB中的IL-17通路相关成分**
UPLC-Q-TOF-MS/MS分析共鉴定出1203个代谢物,主要类别包括黄酮类、萜类、酚类和生物碱类。网络药理学预测的与IL-17通路相关的高连接度化合物(如槲皮素、山奈酚)及其衍生物被确认存在于YFB中。此外,还鉴定出酰基化糖苷和甲基化衍生物等结构修饰的黄酮类化合物,这些修饰可能提高其生物利用度和代谢稳定性。定量分析显示,咖啡酸和绿原酸是含量最丰富的成分。
**YFB保护小鼠免受DSS诱导的急性结肠炎**
与正常对照组相比,DSS模型组小鼠出现显著的体重下降、DAI升高、结肠缩短和脾脏指数升高。YFB治疗(3.325, 6.65, 13.3 g/kg)剂量依赖性地逆转了这些变化,效果与阳性对照药5-氨基水杨酸(5-ASA)相当。H&E染色显示,YFB减轻了DSS引起的炎性浸润、隐窝扭曲和上皮损伤。PAS染色表明,YFB阻止了DSS诱导的杯状细胞丢失和粘蛋白耗竭。对心、肝、肾组织的H&E染色未发现明显病理改变,提示在测试剂量下无急性毒性。
**YFB抑制炎症、恢复屏障完整性并促进结肠炎小鼠的上皮修复**
通过qPCR和ELISA检测发现,YFB治疗逆转了DSS诱导的Muc2 mRNA水平下降,并剂量依赖性地降低了促炎细胞因子(IL-1β、IL-6、IL-17A、TNF-α)以及炎症介质(Cxcl2、Cox2)的mRNA和蛋白水平。免疫组化(IHC)分析证实,YFB上调了粘蛋白MUC2、紧密连接蛋白ZO-1和Occludin的表达。此外,YFB恢复了DSS结肠炎中减少的LGR5?肠道干细胞和SOX9?祖细胞,并纠正了异常增加的CHGA?内分泌细胞。在信号通路层面,YFB抑制了磷酸化p65(p-p65)的核积累和COX2的表达,表明其抑制了NF-κB通路的激活。
**YFB治疗与DSS诱导的肠道菌群失调的逆转相关**
16S rRNA基因测序分析显示,DSS模型组中反映菌群丰富度和多样性的Chao1和Shannon指数显著降低,而YFB治疗使其恢复至接近正常水平。β多样性分析(PCoA和NMDS)显示,YFB组的微生物群落结构更接近正常对照组,远离DSS模型组。在菌群组成上,YFB治疗逆转了DSS引起的微生物群变化:在门水平,增加了Bacteroidota和Bacillota的相对丰度,减少了Verrucomicrobiota;在科水平,富集了有益菌群如毛螺菌科(Lachnospiraceae)和乳杆菌科(Lactobacillaceae),抑制了机会致病菌肠杆菌科(Enterobacteriaceae)的扩增;在属水平,YFB组富集了短链脂肪酸(SCFA)产生菌Lachnospiraceae\_NK4A136\_group,并减弱了DSS诱导的Akkermansia和Escherichia-Shigella的过度增长。LEfSe分析进一步确定了各组特异性的标志性菌群。
**YFB治疗与粪便代谢组学图谱的改变相关**
非靶向代谢组学分析显示,YFB治疗改变了DSS诱导的粪便代谢谱。PLS-DA分析显示YFB组与DSS组明显分离。鉴定出多个差异代谢物,包括脂肪酸(如棕榈油酸、肉豆蔻酸、α-亚麻酸)、尿酸和溶血磷脂酰胆碱(LysoPCs)等,YFB治疗有效逆转了这些代谢物的紊乱水平。KEGG通路富集分析显示,差异代谢物与色氨酸代谢、ABC转运蛋白等通路显著相关。基因集富集分析(GSEA)发现,DSS组中“不同环境中的微生物代谢”通路被显著激活,而YFB治疗显著抑制了该通路的激活。
#### 总结与讨论
本研究讨论部分首先指出,此前已有研究证实了YFB的抗结肠炎疗效,例如通过抑制TLR4/NF-κB/NLRP3通路修复肠道上皮屏障,以及利用网络药理学和16S rRNA测序报告其对肠道菌群的调节作用。本研究在此基础上做出了增量贡献:首先,通过非靶向代谢组学发现YFB治疗与肠道菌群代谢功能的改变相关,而不仅仅是菌群组成的改变;其次,发现YFB治疗与恢复LGR5阳性肠道干细胞和SOX9阳性祖细胞,并纠正CHGA阳性内分泌细胞的异常扩增相关,这是一个此前未报道的机制;第三,通过qPCR、ELISA和IHC验证了网络药理学预测的核心通路(NF-κB、IL-17、TNF)。
研究人员提出了一个综合模型(图7),说明YFB通过其生物活性成分(如槲皮素和山奈酚)协调恢复“肠道屏障-微生物-代谢”轴:抑制NF-κB驱动的炎症,上调紧密连接蛋白和粘蛋白,促进肠道干/祖细胞再生,并纠正内分泌细胞群;同时重塑肠道菌群组成,富集有益菌,抑制机会致病菌,并纠正紊乱的粪便代谢物。
研究结论(翻译):
本研究证明,薏苡附子败酱散(YFB)通过协同的多靶点机制预防小鼠DSS诱导的急性结肠炎。YFB的保护作用涉及一个系统性的调节过程:它直接抑制NF-κB活化和促炎细胞因子的产生,同时与肠道菌群的改变相关,包括抑制机会致病菌和富集已知能产生短链脂肪酸的有益菌。这些作用共同恢复了肠道屏障的完整性并纠正了宿主-微生物共代谢紊乱。最终,YFB通过协调调节肠道屏障–微生物–代谢轴发挥其功效。研究人员的发现为YFB的临床应用提供了坚实的科学依据,并强调了中药复方通过系统级调节治疗复杂、多因素疾病的价值。