索马里下谢贝利地区牛只中边缘无形体的分子检测与特征分析

《Parasites & Vectors》：Molecular detection and characterization of Anaplasma marginale in cattle from the Lower Shabelle Region of Somalia

　　

摘要

背景

Anaplasma marginale是一种重要的蜱传病原体，对全球牛业造成严重影响，但其在索马里的情况仍不甚明了。本研究旨在调查索马里下沙贝尔地区牛群中A. marginale的分子和血清学存在情况以及其遗传多样性。

方法

从牛群中采集了131份血液样本，同时收集了关于地理位置、身体状况以及蜱虫存在的流行病学数据。测量了红细胞压积（PCV），并使用商业化的基于rMSP5的ELISA方法检测血清中是否存在抗A. marginale IgG抗体。通过针对msp1β基因的qPCR进行分子检测，对于阳性样本，进一步通过PCR扩增和测序msp1α及msp4基因，并进行生物信息学分析。

结果

在131头牛中，有110头（83.9%）存在针对A. marginale的IgG抗体，而121头（92.4%）在针对msp1β基因的qPCR检测中呈阳性。血清阳性组和阴性组之间的红细胞压积中位数存在显著差异（p＝0.026）。qPCR阳性结果与蜱虫感染程度及身体状况无显著关联。血清学检测与qPCR检测的结果一致性较差（κ＝0.28）。在进一步分析的32个qPCR阳性样本中，31个（96.9%）为msp1α阳性，且全部为msp4阳性。研究还发现了10种新的msp1α序列以及5种此前已报道的短序列重复序列，而msp4分析则发现了18种基因型，索马里的分离株与非洲和俄罗斯的菌株属于同一类群。

结论

本研究证实了索马里牛群中A. marginale的高流行率及其遗传多样性，强调了加强监测和防控措施的必要性。

图形摘要