瑞典养猪场抗性基因组的纵向研究

《npj Antimicrobials and Resistance》：Longitudinal investigation of the resistomes in Swedish pig farms

　　

摘要

我们在一个抗菌药物使用较少的环境中，对瑞典十家养猪场的环境抗性组与微生物组进行了纵向研究。样本来自猪圈环境，并通过鸟枪法宏基因组测序进行分析。抗性组与微生物组的特征变化更倾向于随时间变化，而非因农场差异而变化，且存在多种与年龄相关的趋势。微生物组与抗性组的年龄相关变化规律不同，这表明抗性动态还受到微生物更替之外的因素影响。相对而言，四环素类抗生素的抗性决定因子含量最高，其次是氨基糖苷类、大环内酯类-林可酰胺类-链霉素类抗生素、β-内酰胺类以及叶酸合成抑制剂——这些都是瑞典养猪业中常用的药物类别。这些抗性组模式与以往研究中的表型抗性特征有一定关联，但仅分析抗菌药物的使用情况无法完全解释所观察到的抗性组特征。总体而言，这些研究结果表明，除了抗菌药物的使用之外，还有其他因素影响着抗生素抗性基因在养猪场环境中的持续存在与传播。