DNA甲基化亚型作为儿童肾上腺皮质肿瘤预后生物标志物的验证：对COG ARAR0332临床试验结果的重新评估

《npj Precision Oncology》：Validation of DNA methylation subtype as a prognostic biomarker in pediatric adrenocortical tumors: re-evaluation of results from the COG ARAR0332 clinical trial

　　

摘要

儿童肾上腺皮质肿瘤是一种罕见的肿瘤，目前可用于风险分层的生物标志物十分有限。此前通过国际儿童肾上腺皮质肿瘤登记库的数据鉴定出的两种基于DNA甲基化的分子亚型（A1和A2）与肿瘤预后密切相关：A1亚型与不良预后相关，而A2亚型则与进展缓慢的疾病相关。本研究的目的是在儿童肿瘤学组ARAR0332试验队列中验证这些分子亚型在预后评估中的实用性（ClinicalTrials.gov编号：NCT00304070，注册日期：2006年3月15日）。研究使用基于DNA甲基化的神经网络分类器，该分类器经过60个参考样本的训练，用于将ARAR0332试验中的样本分为A1、A2或正常肾上腺三类。随后将这些分类结果与临床指标、基因组特征以及生存情况进行了对比分析。在ARAR0332试验的样本中，有11例（22%）被归为A1亚型，38例（78%）被归为A2亚型。A1亚型肿瘤多见于年龄较大的患者，且常伴有转移性病变、库欣综合征以及CTNNB1基因突变；而A2亚型肿瘤多出现在较年轻的患者身上（平均年龄为4.1岁），这类患者更常出现男性化表现。与A2亚型肿瘤相比，A1亚型肿瘤的5年无事件生存率和总生存率显著更低。在患有非转移性肿瘤的患者中，即便考虑到临床分期以及根据Wieneke标准确定的组织病理学风险等级，甲基化分类仍是一个重要的风险预测因素。总体而言，我们的研究结果表明，将甲基化分类结果与临床分期及组织病理学特征结合使用，有望在未来针对不同风险特征的临床试验中实现更精准的风险分层。