2020年至2022年韩国SARS-CoV-2流行病学特征的变化：非药物干预措施作用的间接证据

《Scientific Reports》：Changes in the epidemiological patterns of SARS-CoV-2 in South Korea from 2020 to 2022: indirect evidence for the impact of non-pharmaceutical interventions

　　

摘要

自2019年底出现以来，2019冠状病毒病（COVID-19）大流行已对全球公共卫生造成严重影响。本研究旨在分析2020年至2022年期间韩国境内SARS-CoV-2的传播时空动态，重点探讨检疫政策变化及病毒谱系演化所带来的影响。研究利用77,224个高质量的全基因组序列，通过系统发育分析来评估不同疫情阶段中的病毒谱系引入情况、替换率以及隐性传播模式。此外，还通过贝叶斯系统地理学分析来重建韩国境内的传播路径。研究结果表明，在检疫措施放宽后，尤其是奥密克戎亚型占主导地位的时期，单系群的数量显著增加。系统地理学分析显示，首尔和京畿道是韩国全国范围内主要的传播中心。替换率分析则显示，随着时间推移替换率逐渐下降，奥密克戎亚型的进化速度明显慢于早期变异株。虽然检测到一种新的重组变异株，但它并未导致持续的传播。这些发现为非药物干预措施在限制新病毒的引入和传播方面的有效性提供了间接证据，不过这类措施无法完全防止疫情爆发。在准备应对未来的大流行时，应考虑对这些控制策略进行优化和加强。