一项关于大型良性前列腺增生中内皮细胞活化特征的单细胞RNA测序初步研究

《Scientific Reports》：A pilot single-cell RNA sequencing study of endothelial activation signatures in large benign prostatic hyperplasia

　　

摘要

良性前列腺增生在老年男性中较为常见，但增生前列腺中的内皮细胞情况仍不明确。在这项旨在提出假设的初步研究中，我们从6个通过手术获取的良性前列腺增生样本（3个大体积样本和3个小体积样本）中获得了单细胞RNA测序数据，共分析了56,912个细胞；同时使用了公开数据集GSE290213和GSE242249作为参考。我们发现大体积样本中活化内皮细胞的比例较高，而类静脉内皮细胞的比例较低，但这些描述性统计结果并非用于正式的群体推断。通过RNA速度分析、图谱排序以及Slingshot/tradeSeq分析，我们确定了可能的内皮细胞状态排序；图谱伪时间与潜在时间的一致性较低（Spearman rho=0.252）。方差分解结果显示，AP-1/NF-κB活性主要与内皮细胞状态相关，而某些与IFN/HLA-II相关的基因表达模式则显示出更强的群体相关性。MAGMA和TWAS分析并未将活化内皮细胞标记物或与大体积样本相关的内皮基因视为主要遗传信号；与遗传数据更为一致的是更广泛的间质-血管及HLA相关模式。这些研究结果为未来在具有蛋白质水平检测的更大规模临床标注队列中进行验证提供了内皮细胞活化特征及双轴探索模型。