《Scientific Reports》：Prevalence, antimicrobial resistance, and virulence factors of Enterococcus spp. infecting broiler chickens in Egypt
编辑推荐：
粪肠球菌属（Enterococcus spp.）是肉鸡中的潜在病原体，除造成经济损失外，还具有在不同细菌物种间获取和传播抗菌药物抗性基因（AMRGs）的强大能力。本研究旨在调查埃及基纳（Qena）和索哈格（Sohag）省肉鸡中肠球菌感染的 occurrence
粪肠球菌属（Enterococcus spp.）是肉鸡中的潜在病原体，除造成经济损失外，还具有在不同细菌物种间获取和传播抗菌药物抗性基因（AMRGs）的强大能力。本研究旨在调查埃及基纳（Qena）和索哈格（Sohag）省肉鸡中肠球菌感染的 occurrence，确定肠球菌分离株的抗菌药物敏感性及毒力因子（VFs），并通过PCR筛查1类和2类整合子（integrons）。研究人员从30个不同商品化农场的1至35日龄患病肉鸡中采集120份样本。对禽只进行临床和细菌学肠球菌检查，随后测定分离株的抗菌药物敏感性及毒力因子，并通过PCR检测部分基因。肠球菌从22.5%受检禽只中分离得到，鉴定为屎肠球菌（E. faecalis）、粪肠球菌（E. faecium）和鸡肠球菌（E. gallinarum），流行率分别为11.7%、7.5%和3.3%。感染禽只表现为跛行、体重减轻、关节炎、雏鸡卵黄囊感染，部分禽只出现败血症和心内膜炎。所有肠球菌分离株均产明胶酶（gelatinase），其中18.5%和81.5%分别为β-溶血性和不同等级的生物膜形成者。就分离株的抗菌药物敏感性而言，63%为多重耐药（MDR）肠球菌，其中1类整合子阳性分离株中MDR发生率更高（70.6%）。PCR显示，分别有100%、81.5%、74.1%、74.1%、48.1%、37.0%、7.4%和3.7%的分离株携带gelE、aac(6′)/aph(2″)、ermB、tetM、int1、cylA、vanA和int2基因。本研究证实肉鸡中致病性MDR肠球菌高流行，对家禽健康构成危害并具潜在公共卫生意义。此外，据研究人员所知，本研究首次报道埃及肠球菌中1类整合子高流行。因此，亟需实施严格的生物安全协议和审慎的抗菌药物管理策略。
研究背景与立项依据
肠球菌属（Enterococcus spp.）为革兰氏阳性兼性厌氧球菌，是哺乳动物、鸟类及爬行动物胃肠道常驻菌群，同时作为机会性病原体可引发禽类关节炎、骨髓炎、心内膜炎及雏鸡卵黄囊感染，造成生长迟缓与屠宰废弃等经济损失。该菌属凭借可移动遗传元件（MGEs）快速获得并水平转移抗菌药物抗性基因（AMRGs），其中1类与2类整合子（class 1 and 2 integrons）在革兰氏阳性菌中近年才被确认参与多重耐药（MDR）形成。埃及肉鸡产业占全国禽肉消费约95%，但既往关于肠球菌在肉鸡中的研究多集中于其他省份，基纳与索哈格省尚无报道，且埃及范围内关于禽源肠球菌携带整合子的数据缺失。鉴于禽源肠球菌可能经食物链向人群传播耐药基因，研究人员于《Scientific Reports》发表本研究，系统调查两省肉鸡肠球菌感染率、表型与基因型耐药谱、毒力因子（VFs）及整合子分布，为“同一健康（One Health）”框架下的防控提供依据。
主要技术方法概述
研究人员在埃及基纳与索哈格省30个商品化肉鸡场随机采集1–35日龄患病禽只组织样本（卵黄囊、心、肝、肺、脾、关节）共120份，经胆汁七叶苷叠氮琼脂初筛、VITEK 2 Compact系统鉴定到种；以血平板、明胶平板及微孔板结晶紫法分别测定β-溶血、明胶酶与生物膜形成（BF）表型；采用Kirby-Bauer纸片扩散法对15种抗菌药物判读敏感性并按≥3类耐药定义为MDR；提取基因组DNA后PCR扩增gelE、aac(6′)/aph(2″)、ermB、tetM、vanA、int1、int2、cylA等靶基因；最后用Fisher精确检验分析表型—基因型及整合子与MDR关联。
研究结果
临床与剖检发现
患病肉鸡表现精神沉郁、羽毛蓬乱、跛行和减重；剖检见关节炎、败血症、心内膜炎及雏鸡卵黄囊炎，与肠球菌机会性感染特征一致。
肠球菌流行率与菌种组成
120份样本中27份（22.5%）分离出肠球菌，经VITEK 2鉴定为屎肠球菌（E. faecalis）14株（11.7%）、粪肠球菌（E. faecium）9株（7.5%）、鸡肠球菌（E. gallinarum）4株（3.3%），屎肠球菌为优势种。
毒力因子与对应基因
全部27株均表型产明胶酶且携gelE（100%）；18.5%呈β-溶血，而cylA基因阳性率37.0%，两者显著不一致（P=0.001），提示溶血表型需完整cyl操纵子而非单基因决定；81.5%分离株具生物膜形成能力，其中屎肠球菌、粪肠球菌、鸡肠球菌中BF比例分别为85.7%、88.9%、50.0%。
抗菌药物耐药性与MDR
分离株对万古霉素（VA）100%敏感，对阿莫西林/克拉维酸（AMC）、恩诺沙星（ENR）敏感率均92.6%；对林可霉素（L）、四环素（T）耐药率最高（各66.7%），红霉素（E）63.0%，庆大霉素（CN）51.9%。63.0%为MDR。基因型上aac(6′)/aph(2″)、ermB、tetM、vanA阳性率分别为81.5%、74.1%、74.1%、7.4%；表型—基因型存在解离，如部分携vanA株VA敏感，部分携ermB株对红霉素敏感，反映基因静默或调控差异。77.8%林可霉素耐药株携ermB。
1类与2类整合子分布及关联
int1阳性率48.1%，int2阳性率3.7%，为埃及禽源肠球菌首次报道。int1阳性株中MDR比例达70.6%，且92.3%为BF阳性；统计显示int1与ermB携带及MDR显著相关，提示1类整合子作为MGEs促进AMRGs集聚与水平转移，并与生物膜群落内密切接触协同放大耐药传播。
讨论部分总结
研究人员指出，22.5%的分离率介于埃及其他省份7.7%–61.8%报道之间，反映地理与管理差异。屎肠球菌主导与多数家禽研究一致。毒力上gelE全覆盖支持明胶酶为核心侵袭因子；cylA阳性而溶血阴性归因为操纵子不完整或下调。MDR率63%与意、德家禽研究相近，但高于韩国零售鸡肉研究，指向埃及局部抗菌药物无序销售与促生长用药压力。万古霉素全敏感区别于埃及部分既往研究，但vanA隐匿携带警示未来演化风险。整合子数据中1类高流行且绑定MDR与BF，首次在埃及禽源系统呈现，呼应革兰氏阳性菌中整合子新兴角色；研究人员也坦承样本量限于两省、未用MIC与测序定位整合子基因盒为本研究边界。
结论翻译
本研究证实埃及基纳与索哈格省肉鸡中致病性MDR肠球菌高流行，对家禽健康构成危害并具有潜在公共卫生意义；此外，据研究人员所知，首次在埃及报道禽源肠球菌携带高比例1类整合子。因此，亟需紧急实施严格生物安全协议与审慎抗菌药物管理策略。
