完整的参考基因组揭示了芸苔属着丝粒的遗传特征

《Genome Biology》：A complete reference genome reveals genetic landscape of Brassica centromeres

　　

摘要

着丝粒对染色体的分离至关重要，但在多倍体作物中，其结构与进化机制仍不甚明了。我们首次完成了甘蓝型油菜品种中黄11号的端粒到端粒的完整参考基因组构建，并分析了着丝粒的结构与进化特征。我们确定了构成着丝粒的核心卫星重复序列，同时发现了与多倍体化和驯化相关的亚基因组之间存在广泛的序列多态性及结构差异。此外，我们还发现了由于染色体反复重排而产生的富含rDNA的着丝粒周边区域，并提出了一种着丝粒进化循环模型，用以解释卫星重复序列和转座子如何共同影响着丝粒的进化。