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大片段基因实验,TA能帮您
【字体: 大 中 小 】 时间:2026年07月13日 来源:基因有限公司
编辑推荐:
基因兔博士给您带来长片段核酸纯化集锦
如下长片段基因涉及的实验,您那边有在做吗?
大片段酶切凝胶回收(10–50 kb)
BAC / 超大质粒克隆(50–300 kb)
长读测序(Nanopore/PacBio,>50 kb gDNA)
提取的核酸是否遇到如下问题:
核酸最长的片段仅有20kbp
核酸得率很低,完全不够下游实验的应用
纯度不高,影响下游测序或者酶切
备受打击

为什么会遇到这类问题:
1. 机械剪切断裂:涡旋、高速吸打、高速离心、细吸头、反复冻融都会切碎长链
2. 常规硅胶离心柱截留 / 断裂超长 DNA(柱膜孔径小,>20 kb 极易堵柱、断链)
3. 长片段吸附 / 洗脱效率低,易不可逆吸附在塑料管壁
4. 核酸酶微量降解、高盐 / 有机溶剂易导致长链变性、缺口
基因兔博士给您带来长片段核酸纯化集锦

法宝一:PCR&胶大片段核酸产物纯化——NucleoTrap®大片段纯化试剂盒(20bp-50kpb)

基于悬浮硅珠技术的回收方案,可回收20bp-50kpb之间的片段。
这种技术的不同之处在于:整个过程DNA都在溶液中进行,通过与悬浮的硅珠温和地结合、洗涤,最后再被洗脱。就像用手轻轻托起一条大鱼,而不是用网兜猛拉上来,最大限度地避免了机械损伤。
这不仅仅是理论上的优越。实测数据表明,NucleoTrap®对于长达19.4 kb的DNA片段,仍能保持高达74%的回收率。而对于更长的片段(最高至50 kb),只需在洗脱时稍加优化(如在55°C孵育),就能获得极致效果。
不同片段大小基因的回收效率:

两款产品该如何选择呢?
• 如果你需要从凝胶里切下一个DNA条带(无论大小)进行回收,请选择 NucleoTrap®;
• 如果你的PCR反应完成后,想直接纯化反应液中的目的产物(并去除引物二聚体等小杂质),请选择 NucleoTrap®CR
法宝二:大结构质粒提取——NucleoBond BAC 系列(<300kbp)
特殊的二氧化硅阴离子交换树脂,允许裂解液、洗涤液和洗脱液重力过柱,无需离心机离心,超快速纯化 cosmids 和大结构(P1, BAC, PACs)质粒,最大质粒回收片段可达 300 kbp,同时保护质粒形态。
NucleoBond BAC 100 试剂盒
采用一代阴离子交换树脂技术;NucleoBond® Folded Filter 折叠滤纸进行裂解液澄清。

NucleoBond® Folded Filter
产品参数

NucleoBond Xtra BAC试剂盒
采用二代阴离子交换树脂技术,流速更快,得率更高;NucleoBond Xtra BAC Column Filters 和阴离子树脂结合,实现裂解液过滤和过柱一步完成。

产品参数

法宝三:长读长测序核酸抽提——NucleoBond®& Monarch®
NucleoBond® HMW 核酸抽提试剂盒
NucleoBond® HMW采用阴离子交换色谱技术来进行核酸纯化。完整性高、纯度好的核酸成为常用的 long-read 测序技术(如 SMRT 和 Nanopore)以及 long-range short-read 测序方法(如 Next GEM(10× Genomics))的理想选择。

片段长,最长可达 200 kbp:
裂解液重力过柱,无需离心,减少了离心力对核酸的破碎作用,尽量保证核酸原生态,最长片段可达 200 kbp。
纯度高:
采用了阴离子交换色谱技术,对核酸下游应用有抑制作用的组分均被清除,核酸纯度较高。
样本类型广:
相比以往的核酸抽提产品,这款试剂盒可以覆盖大多数样本类型,并且支持更大的上样量,比如 1.5 g 植物组织、300 mg 微生物样本(革兰氏阴性/阳性菌、酵母菌)、300 mg 动物组织、2 ml 血液/体液、107个细胞(酶裂解法)等。
速度快:
包括 30 min 的裂解时间在内,整个提取过程 2 h。
客户测试结果:

图1

图2
DNA 来自植物样本黄褐棉,使用 NucleoBond® HMW DNA 试剂盒进行核酸纯化。如图1所示,在 164251 bp检测到主峰,最长片段可达 200 kbp。图2,核酸得率和纯度表现。
Monarch® 高分子量 DNA 提取试剂盒
(用于细胞和血液:NEB #T3050,用于组织和其他样本:NEB #T3060)

核心技术:玻璃微珠-振荡裂解,通过转速梯度(500–2000 rpm)主动控制片段大小
• 快速且简便的工作流程(细胞:30 min,血液:60 min,组织 / 细菌:90 min),让您在同一天完成从样本到测序的全流程;
• 可以从细胞、血液、软器官组织和细菌中获得 Mb 级别的超高分子量 DNA(UHMW DNA);
• DNA 片段大小可通过裂解过程中的搅拌速率进行调节,使用灵活,可以根据测序需求进行优化。

Monarch 组织高分子量 DNA 提取试剂盒从组织和细菌中提取高分子量基因组 DNA
