人类Th1细胞和GZMK? CD8? T细胞中针对CMV的克隆扩增

《Genome Biology》：CMV-specific clonal expansion in human Th1 and GZMK? CD8? T cells

　　

摘要

背景

巨细胞病毒（CMV）是一种常见的疱疹病毒，会在体内长期潜伏，并且随着年龄增长其感染率逐渐上升。为系统地从单细胞层面揭示CMV引发的免疫重塑现象，我们利用单细胞RNA测序、T细胞受体（TCR）测序以及流式细胞术，对六个不同的人群队列（包括两个新建立的队列）进行了分析。

结果

我们发现了与CMV相关的细胞频率变化，包括GZMK? CD8? T细胞和异常B细胞的数量增加，CD56dim NK细胞的数量减少，同时还有CD4?/CD8? TEMRA细胞以及适应性NK细胞的常规性增殖。通过对一名血清转化个体的纵向监测，我们发现循环免疫细胞频率会因CMV而迅速发生变化。借助最近发布的CMV特异性TCRβ数据库，并结合预测模型（CMVerify），我们发现了在两个独立队列中都存在的新型CMV特异性克隆增殖现象。在CD8?细胞谱系中，CMV特异性克隆主要存在于GZMK? CD8? T细胞和CD8? TEMRA细胞中；而在CD4?细胞谱系中，Th1细胞则与CD4? TEMRA细胞一同出现克隆增殖现象。

结论

这项多队列整合研究明确了人类体内潜伏CMV的细胞及克隆特征，同时指出GZMK? CD8? T细胞和Th1细胞是此前未被充分重视的CMV反应相关成分。