结合文化依赖性与文化独立性研究方法，通过筛选产色素菌株，探索波兰地区荨麻属植物内生细菌的多样性

《Microbial Cell Factories》：Integrating culture-dependent and culture-independent approaches to explore the diversity of endophytic bacteria associated with Urtica dioica L. in Poland with screening of pigment-producing isolates

　　

摘要

背景

植物在不断变化的环境条件下能够茁壮成长，这要归功于栖息在其组织中的微生物——内生菌。然而，许多内生菌在标准实验室条件下无法生长，而宏基因组分析则有助于了解微生物的多样性及群落结构。本研究旨在比较来自波兰不同地区的荨麻（Urtica dioica L.）的内生细菌群落，包括可培养和不可培养的菌株，并识别出所有地点共有的细菌类群，这些类群可能构成一个核心微生物组。

结果

从各个地区共获得了66株细菌分离株。其中32%的菌株被鉴定出来，大多属于Bacillus和属，这类细菌是多种植物的常见内生菌。尽管仍有大量测序数据未能被分类，但宏基因组数据仍帮助确定了所有样本中都存在的几个属，包括Acinetobacter、Bacillus、Citrobacter、Enterococcus、Escherichia、Klebsiella、Paenibacillus、Salmonella、Vibrio和< />。在这些分离株中，Exiguobacterium sp. SP2-R3表现出最强烈的橙色色素。研究结果表明，这种色素很可能属于醌类物质，且具有不错的清除活性。

结论

这项研究加深了我们对荨麻内生菌群的了解，同时也凸显了将培养法与宏基因组分析相结合的重要性。此外，在那些具有产色素潜力的分离株中，研究还选出了最优秀的产色菌株并对其进行了鉴定。可以认为，这些分离株可能还具备其他有价值的特性，值得进一步研究。