停止交换：将SNPTrace基因分型作为人类类器官生物库菌株的常规鉴定方法

《BMC Research Notes》：Stop the swap: SNPTrace genotyping as routine authentication for human organoid biobank lines

　　

摘要

研究目的

人类类器官细胞系可以长期培养，并且越来越多地通过中央生物库和核心设施进行共享，因此严格的身份追踪对于确保研究的可重复性至关重要。在细胞培养过程中，错误标记和交叉污染依然是持续存在的风险，有历史记录和现有证据表明，身份识别错误可能无法被发现，从而影响生物学研究的结论。本文介绍了如何在生物库/核心设施的工作流程中运用SNPTrace平台对人类类器官细胞系进行基因鉴定。

研究结果

利用SNPTrace，我们为49位供体提供的108个人类类器官细胞系生成了96个SNP基因型，并评估了其在不同追踪场景下的性能。我们比较了来自同一供体同一器官不同区域的类器官、来自同一供体不同器官的类器官，以及同一类器官细胞系的连续传代细胞。在所有这些情况下，SNPTrace分析结果在供体内部都保持稳定且一致，这表明SNPTrace可作为实用的基因“标签”，用于确定供体身份及在核心设施中对细胞系进行长期追踪。此外，由常染色体标记得出的性别判断结果与记录的元数据相符，为样本注释提供了另一种验证方式，有助于发现潜在的差异。将SNPTrace纳入常规生物库质量控制流程，能够实现人类类器官细胞系的标准化鉴定，从而保障后续共享的可靠性。