伊朗西部住院患者中的呼吸道真菌定植：菌种分布及抗真菌药物敏感性规律

《BMC Infectious Diseases》：Respiratory fungal colonization in hospitalized patients in western Iran: species distribution and antifungal susceptibility patterns

　　

摘要

背景

在患有肺部疾病的住院患者中，常常可以观察到呼吸道真菌定植现象；然而，其临床意义、菌种分布以及当地的抗真菌药物敏感性模式仍不完全清楚，尤其是在低收入和中等收入国家。本研究旨在确定呼吸道标本中经培养确认的真菌检出率，描述真菌菌种的分布情况，评估主要分离株的抗真菌药物敏感性特征，并探讨在伊朗西部地区，培养阳性结果与某些人口统计学及临床特征之间的关联。

方法

这项前瞻性横断面观察研究在12个月的时间里（2020年7月至2021年7月）在伊朗西部的两家三级医院开展。共对127份连续的呼吸道标本进行了检测，这些标本包括痰液（依据巴特利特标准进行质量评估）、支气管肺泡灌洗液以及气管抽吸物，检测方法包括直接显微镜观察和真菌培养。真菌分离株的鉴定则采用了传统的表型检测方法和分子检测方法相结合的方式。对于酵母菌分离株，使用了CHROMagar试剂、芽管试验以及碳水化合物同化分析；而丝状真菌则通过表型检测进行初步鉴定，对于具有代表性的分离株还通过ITS rDNA测序进行确认。主要分离株的抗真菌药物敏感性测试则采用CLSI推荐的肉汤微稀释法进行（酵母菌使用M27 A4方法，丝状真菌使用M38 A2方法）。最小抑菌浓度的解读则参考了CLSI制定的各菌种特异性临界值或现有的流行病学阈值；对于Candida glabrata，氟康唑的MIC值被归为“敏感但剂量依赖”类别，而对于Aspergillus属的真菌，根据ECV值将其分为野生型和非野生型。人口统计学和临床数据则从医疗记录中获取。

结果

在127份呼吸道标本中，有62份检测到真菌生长，占比为48.8%。其中酵母菌占所有分离株的大多数，比例为71.0%。Candida albicans是最常见的菌种，占比为37.1%，其次是C. glabrata（17.7%）、C. tropicalis（9.7%）以及C. parapsilosis（6.5%）。在丝状真菌中，Aspergillus flavus是最常见的霉菌，占比为9.7%，其次是Rhizopus属真菌（6.5%）、A. fumigatus（4.8%）、A. niger（4.8%）以及 Penicillium属真菌（3.2%）。在各类标本中，痰液标本的培养阳性率最高，为51.9%，其次是支气管肺泡灌洗液（44.4%），气管抽吸物的培养阳性率为33.3%；不过这些差异在统计学上并不显著（p?=?0.19）。培养阳性结果与年龄、性别、COPD、肺炎、恶性肿瘤、糖尿病或COVID-19感染状态等人口统计学或临床变量之间均无显著关联；但由于样本量有限，这些结论需谨慎对待。C. albicans分离株对所检测的抗真菌药物表现出较高的敏感性（氟康唑的MIC??和MIC??值分别为0.5和2 μg/mL），而C. glabrata分离株的氟康唑MIC值则较高，有36.4%的分离株被归为“敏感但剂量依赖”类别。所有被检测的A. flavus分离株根据CLSI的ECV值，都被判定为两性霉素B和伏立康唑的野生型。

结论

在疑似患有下呼吸道疾病的住院患者的呼吸道标本中，经培养确认的真菌检出率相当高。其中酵母菌，尤其是Candida属真菌占据主导地位，而A. flavus则是最常见的霉菌，这些情况反映了该地区的流行病学特征。不过，由于从呼吸道分泌物中检测到Candida菌几乎总是代表定植而非感染，因此不应在非中性粒细胞减少的患者中常规使用抗真菌药物治疗。虽然培养阳性结果与诸多临床变量之间无显著关联，但这可能是因为样本量有限，且关于ICU入住、机械通气、糖皮质激素使用等具有临床意义的危险因素的数据也不完整。这些研究结果强调了在解读呼吸道真菌培养结果、进行菌种鉴定以及开展抗真菌药物敏感性测试时需谨慎行事，而这些工作都是抗真菌药物合理使用管理的重要组成部分。未来需要开展更大规模的多中心研究，全面评估各种风险因素、真菌生物标志物，并进行长期随访，以进一步明确呼吸道真菌定植的临床意义及其发展为侵袭性疾病的潜在可能性。