对基因和蛋白质表达数据的整合分析揭示了用于卵巢癌预后的新基因簇
《International Journal of Molecular Sciences》:Integrative Analysis of Gene and Protein Expression Data Reveals Novel Clusters for Ovarian Cancer Prognosis
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时间:2026年08月10日
来源:International Journal of Molecular Sciences 5.6
摘要
卵巢癌存在临床异质性,尽管已有大量生物标志物研究,但可靠的预后分层仍然具有挑战性。我们通过对转录组数据和蛋白质组数据进行整合分析,旨在识别卵巢癌中具有不同预后的分子群。研究使用了癌症基因组图谱数据集,分析了146个样本的RNA测序及反相蛋白阵列数据。那些与总生存率存在显著关联的基因(n = 150)和蛋白质(n = 67,p < 0.05)被纳入分析范围;通过均值聚类法,发现了两个在生存率上存在显著差异的患者群体(p = 8.59 × 10?15)。在所有具有显著关联的基因和蛋白质中,SAR2和ACTN4基因及其对应的蛋白质表达水平之间存在高度相关性(相关系数大于0.80)。基因集富集分析显示,由PAX2和BCL6转录因子调控的基因显著富集。这些被识别的患者群体在另外六个包含617名患者的公共转录组数据集中也得到了验证,这些数据同样显示出了患者群体之间在生存率上的明显差异(p < 0.05)。在另一个独立患者队列中,基于九种蛋白质的免疫组化表达谱进行的聚类分析也显示出两组患者在生存率上的显著差异(p = 0.04)。通过对多组学数据的整合分析,我们实现了对卵巢癌的精准预后分层,同时揭示了其背后的分子和生物学特征。
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