弥漫性大B细胞淋巴瘤中长非编码RNA ROCR、CFLAR-AS1、ST7-AS1及ST7-AS2的表达谱：一项针对GCB与非GCB亚型的病例对照研究

《BMC Medical Genomics》：Expression profiles of long non-coding RNAs ROCR, CFLAR-AS1, ST7-AS1, and ST7-AS2 in diffuse large B-cell lymphoma: a case-control study focusing on GCB and non-GCB subtypes

　　

摘要

背景

弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）可进一步分为生发中心B细胞型（GCB）和非生发中心B细胞型/活化B细胞型（non-GCB/ABC），这两种亚型在临床表现、表型特征及遗传特性上存在显著差异。研究DLBCL的分子机制并制定针对性的分子层面治疗策略，有助于提高诊断精度和治疗效果。随着测序技术的进步，已有多种在DLBCL中表达异常的长链非编码RNA被识别出来。本研究旨在通过生物信息学方法筛选出具有诊断潜力的长链非编码RNA，并通过实验加以验证。

方法

GSE207388基因表达数据集来自基因表达综合数据库。首先运用RNA测序算法的显著性分析来确定差异表达基因，随后对共同表达的基因进行GO和KEGG功能富集分析。2023年至2024年间，从伊朗的两家医院收集了261名DLBCL患者和123名对照组的淋巴结组织样本。通过定量实时PCR检测基因表达水平，再利用ROC曲线分析来评估所筛选长链非编码RNA的诊断潜力。

结果与结论

该数据集包含了19,305个基因的表达谱，根据倍变率大于2且p值小于或等于0.001的标准，最终筛选出了299个基因。通过GO和KEGG富集分析，进一步确定了ROCR、CFLAR-AS1、ST7-AS1和ST7-AS2这四种关键长链非编码RNA作为后续分析对象。对比DLBCL患者与对照组、非GCB亚型与GCB亚型后，发现这四种长链非编码RNA的表达水平在DLBCL组中明显更高。ROC曲线分析表明，这些长链非编码RNA具备较强的诊断潜力，尤其是ST7-AS2。这些发现极大加深了我们对DLBCL分子机制的理解，有望为制定更精准的治疗策略提供依据。