综述：脊索瘤的分子图谱：从多组学到人工智能的当前前沿进展

《Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Reviews on Cancer》：The molecular landscape of chordoma: Current frontiers from multi-omics to artificial intelligence

　　

摘要

脊索瘤是一种罕见的、恶性程度高的轴向骨骼肿瘤，由于其复杂的解剖位置以及高达85%的复发率，长期以来一直给临床医生带来挑战。本综述总结了脊索瘤研究领域的最新进展，介绍了多组学技术、先进免疫学方法以及人工智能如何正在改变该疾病的治疗模式。在脊索瘤的发病机制中，T-box转录因子Brachyury起着关键作用，本文将其视为具有诊断意义的标志物，同时也是治疗的主要靶点。针对这一靶点的创新疗法包括共价小分子结合剂、靶向蛋白质降解技术，以及旨在攻击细胞内致癌蛋白的肽基CAR-T细胞。肿瘤的免疫微环境具有动态特性，因此人们正在开发新的细胞疗法，如双特异性CAR结构及NK细胞平台，以消除免疫抑制因子。除了生物学方面的见解外，本文还强调了计算生物学的作用，尤其是深度学习与机器学习模型在肿瘤分割和个性化生存期预测方面所展现出的高精度能力。通过整合基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据，多组学方法能够全面揭示脊索瘤的不同亚型及其耐药机制，从而为制定更精准、个性化的治疗策略奠定基础。

章节节选

引言

脊索瘤是一种罕见的、恶性程度高的轴向骨骼肿瘤，起源于原始胚胎脊索的异常残留组织。该疾病的发病率约为每10万人口每年0.08–0.1例，占所有原发性恶性骨肿瘤的1–4% [1]。脊索瘤多发生在55至60岁之间，儿童和青少年中较为少见，且男性患病比例略高 [2]。虽然脊索瘤可能在不同部位形成

脊索瘤：从临床表现到分子发病机制

世界卫生组织将脊索瘤分为三种亚型：常规型、去分化型和低分化型脊索瘤，它们在形态特征、临床预后及生存率方面存在差异。最常见的常规型脊索瘤其特征是具有囊状细胞的黏液样间质，这些细胞呈束状或小叶状排列。尽管生长缓慢，但局部侵袭性较强，其总体中位生存期

Brachyury基因

目前普遍认为，脊索瘤起源于胚胎脊索的残留组织，而脊索是发育过程中至关重要的临时结构。这些残留的脊索细胞可形成良性脊索病变，如发生率为0.5–2%的囊状脊索瘤，以及良性脊索细胞肿瘤 [22]。由于这些病变都具有相同的脊索起源、相似的组织学特征，且都易发生在轴向骨骼上，因此有研究推测它们可能存在某种关联

脊索瘤的免疫学特征

肿瘤微环境是一个由免疫细胞（包括先天性和适应性免疫细胞）、基质成纤维细胞、内皮细胞以及细胞外基质成分构成的复杂动态系统。在此背景下，肿瘤免疫微环境特指肿瘤细胞与免疫细胞在富含细胞因子和趋化因子的环境中的相互作用，这种相互作用会影响肿瘤的行为及对治疗的反应 [64]、[65]、[66]、[67]。尽管脊索瘤细胞会表达免疫原性抗原，

从研究到临床应用的液体活检技术

作为液体活检技术的重要组成部分，循环肿瘤DNA为监测治疗反应、克隆选择及耐药性的发展提供了无创检测手段。最近有一项诊断研究促使人们开发出了epiMelanoma这一基于高通量cfDNA的DNA甲基化检测方法，该方法能够识别黑色素瘤特有的表观遗传特征。这一新方法不仅能够高度准确地区分黑色素瘤来源的cfDNA与健康个体的cfDNA，还能用于预测

组学研究：脊索瘤研究的新进展

先进的组学技术的发展极大地提升了我们对各种生物系统的理解（见图4）。这些技术还促进了公共数据库和资源的建设（如cBioPortal、TCGA等），使得我们能够分析大规模数据集，进而提升全面开展生物学研究的能力 [125]。多项研究已经发现了脊索瘤中的基因异常和染色体改变，但相关问题仍需进一步研究

结论

脊索瘤是一种罕见且治疗难度较高的恶性骨肿瘤，其发病与脊索起源有关，而Brachyury基因则是该疾病的几乎普遍存在的驱动因素及诊断标志物。虽然手术切除联合辅助放疗仍是目前的标准治疗方法，但由于该疾病具有较高的复发率、复杂的解剖位置，以及内在的分子和免疫异质性，因此有必要向精准医疗方向转变 [143]。近年来，借助多组学技术（如基因组学、

关于手稿撰写过程中生成式AI及AI辅助技术的声明

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患者知情同意声明

由于本研究不涉及任何原始人类受试者数据，因此无需获取患者知情同意。

临床试验注册情况

本研究无需进行临床试验注册。

伦理审批声明

由于本研究完全基于已发表的数据，因此无需进行伦理审批。

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资金支持情况

作者们并未获得任何特定的资金支持用于完成此项研究。

利益冲突声明

作者声明自己不存在任何可能影响本文研究结果的已知财务利益关系或个人关系。

致谢

作者们暂无需要致谢的内容。

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