新疆硼杆菌，一种从中国新疆葡萄砧木中分离出的中度嗜盐细菌

《Archives of Microbiology》：Borborobacter xinjiangensis sp. nov., a moderately halophilic bacterium isolated from grapevine rootstock in Xinjiang, China

　　

摘要

一种革兰氏阴性、兼性厌氧、不能运动且不形成孢子的杆状细菌，被命名为菌株NGMCC 1.201702^T，是从中国新疆维吾尔自治区一个葡萄园的葡萄砧木中分离出来的。该菌株是首次在与植物相关的环境中发现的属细菌。在此之前，该属仅存在于受砷污染的含水层沉积物中。为确定其确切的分类位置，研究人员进行了全面的多阶段分类学研究。菌株NGMCC 1.201702^T的16S rRNA基因序列与 KCTC 52625^T的相似度最高，为98.29%；而其与这一近缘种的数字DNA–DNA杂交率（23.50%）和平均核苷酸同源性（79.70%）均远低于物种划分的标准。该菌唯一的呼吸醌为泛醌-10。含量占比超过10%的主要细胞脂肪酸为C_18:0、环状-C_19:0 ω8c以及综合特征8（C_18:1 ω7c和/或C_18:1 ω6c）。极性脂质成分包括磷脂乙醇胺、磷脂胆碱、磷脂甘油、二磷脂甘油、磷脂单甲乙醇胺、一种未鉴定的氨基磷脂、一种未鉴定的氨基脂质、两种未鉴定的磷脂（PL1–2）以及四种未鉴定的脂质（L1–4）。该菌的基因组DNA G?+?C含量为61.32%。定性检测显示，该菌能产生吲哚类化合物并具备铁载体生成能力。基因组分析还发现了可能与应激适应及铁/色氨酸代谢相关的遗传特征，进一步丰富了这种与植物共生的菌株的生态学信息。基于表型、系统发育、基因组以及化学生态分类学证据，菌株NGMCC 1.201702^T属于属的一个新物种，建议将其命名为 sp. nov.，模式菌株为NGMCC 1.201702^T（= CGMCC 1.61957^T = JCM 37105^T）。